预测蛋白质结构

预测蛋白质结构

科学家发展了一个用小蛋白质的氨基酸序列预测其三维结构的方法，这个问题在计算生物和化学中一直是个难题。在大约40年前研究人员就已经知道蛋白质的结构完全由其氨基酸序列决定，但是揭开结构预测这个谜一直极为困难。不同氨基酸链扭曲和折叠的“计算”空间巨大，计算溶液中蛋白质构象的自由能也相当困难。Philip Bradley和同事用改进了的取样方法与一个物理上现实的全原子自由能相结合，预测了小蛋白质的"de novo"(最低自由能)结构。
报告：Toward High-Resolution de Novo Structure Prediction for Small Proteins, Philip Bradley, Kira M. S. Misura, and David Baker