颜宁引证很恰当
城里这几天因为两Yan的科研文章和对葡萄糖通道研究的贡献进行了一次大讨论，问题的焦点是小Yan没有引用大Y的文章，有些人因此认为小Yan有学术不端的行为。很多这么说的人是没有好好地去看这些文章，有人甚至连小Y的文章都没有看，就义愤填膺地说小Yan不地道，这种说法不仅对小Yan不公正，也不是大Yan写他那文的本意。
其实两个人的研究除了所用的手段不同外，也是不同的基因，大Yan他们研究的是UhpT，而小Yan研究的是XylE。 小Yan在她的第一篇《自然》杂志的文章“Crystal structure of a bacterial homologue of glucose transporters GLUT1–4”里很完整地对前人在同一个基因上的文章进行了引述，一起来看看关键的写研究目的和主要发现的一段：
" To elucidate the structure and molecular mechanism of GLUT1–4, we launched a systematic effort to screen for well-behaved GLUT1–4 protein variants as well as their homologues. Among the tested proteins, the E. coli D-xylose:H+ symporter XylE29,30,31,32,33 showed excellent solution behaviour. XylE, an archetypal member of the SP subfamily19,32, shares sequence identities of 29%, 30%, 29% and 27%, and similarities of 49%, 51%, 48% and 47%, with GLUT1, GLUT2, GLUT3 and GLUT4, respectively (Supplementary Fig. 1). Here we report the crystal structures of XylE bound separately to three different ligands: D-xylose, D-glucose and 6-bromo-6-deoxy-D-glucose (6-BrGlc). We also performed an extensive, structure-guided, in vivo and in vitrofunctional analysis of XylE. These studies reveal significant insights into the structure and function of XylE and its human homologues GLUT1–4."
“为了阐明GLUT1-4的结构和分子机制，我们对GLUT1-4蛋白质变体以及它们的同源物进行了系统的测试。在所测试的所有蛋白质中，大肠杆菌的D-木糖：H1同向转运体XylE (见参考文献29-33）显示出优异的溶液行为。 XylE是SP子系列的原型成员（见参考文献19,32），它和GLUT1，GLUT2，GLUT3和GLUT4氨基酸序列相同性分别为29％，30％，29％和27％，相似之处分别为49％，51％，48％和47％（补充图1）。在这里，我们报告了XylE分别与三种不同的配体即D-木糖，D-葡萄糖和6-溴-6-脱氧-D-葡萄糖（6-BrGlc）结合的晶体结构。同时，我们还利用结构引导方法对XylE离位和在位的功能进行了系统的分析。这些研究对揭示XylE及其人类同源物GLUT1-4的结构和功能都提供了重要的见解。”
单单这一段就引用了前人的六篇文章，主要是来自 Henderson, P. J的实验室研究同一个基因的一些奠基性文章。从这个来看，小Yan不仅是科研做的严谨，论文的背景铺设也很全面，很有逻辑性，而且，该引经注典的地方也都做得很好，她没有引用大Yan的文章是两人研究的不是同一个基因而已，通俗一点就是大Yan吃的是苹果，小Yan吃得是橙子。因此，她可能觉得没有必要去引用大Yan的文章，就是说她没有设法去埋没大Yan在这方面的贡献。
当然，有人可能说她所引用的这些文章都不是研究结构的。是的，但这是因为在她以前没有关于这一蛋白的结构研究，如果有我想她肯定因为其高度相关性会去引用的。在没有这个蛋白结构的情况下，如果小Yan想引用大Yan的关于另外一个蛋白的结构的文章也不是不可。不过如果那样，会不会又有人觉得有点牵强，是故意讨好大Yan呢？毕竟是两个完全不同的通道！
最后，小Yan没有必要去故意隐瞒大Yan的成果，因为即使引用了，也不会对她那发现的新颖性有任何的影响。有人说她的那些突变试验其实不用做，我觉得这是完全不专业的claim，因为每个蛋白都有其特异的结构，即使是同样的氨基酸在不同的蛋白里面对蛋白结构的形成和维持也会有不同的作用，任何一个好奇和负责任的科学家在条件许可的情况下都会自己做的。
综上，小Yan的发现是独立于大Yan的，两者没有重复性，她没提大Yan的文章，是因为两者之间没有直接的关联，再说她的文章是经过严格的专家评审才发表的，因此不存在着任何不适当的行为。那些指责她的言论应该都是来自于不懂专业的人之口，稍微懂点专业的人就不会如此大惊小怪的。
总之，颜宁在她的那些文章里引用什么文献和没有引用什么文献都做得很恰当，没有什么可以指责的地方，大家不要因为她的成功就心里不爽。
(附那段文的参考文献：
19. Henderson, P. J. & Maiden, M. C. Homologous sugar transport proteins in Escherichia coli and their relatives in both prokaryotes and eukaryotes. Phil. Trans. R. Soc. Lond. B 326, 391–410 (1990).
29. Lam, V. M., Daruwalla, K. R., Henderson, P. J. & Jones-Mortimer, M. C. Proton-linked D-xylose transport in Escherichia coli. J. Bacteriol. 143, 396–402 (1980).
30. Davis, E. O., Jones-Mortimer, M. C. & Henderson, P. J. Location of a structural gene for xylose–H1 symport at 91min on the linkage map of Escherichia coli K12. J. Biol. Chem. 259, 1520–1525 (1984).
31. Davis, E. O. & Henderson, P. J. The cloning and DNA sequence of the gene xylE for xylose–proton symport in Escherichia coli K12. J. Biol. Chem. 262, 13928–13932 (1987).
32. Maiden, M. C., Davis, E. O., Baldwin, S. A., Moore, D. C. & Henderson, P. J. Mammalian and bacterial sugar transport proteins are homologous. Nature 325, 641–643 (1987).
33. Henderson, P. J. Proton-linked sugar transport systems in bacteria. J. Bioenerg. Biomembr. 22, 525–569 (1990).)
图一：与D-木糖结合的XylE的结构呈向外的，部分闭塞的构象。
原文链接: https://www.nature.com/articles/nature11524
