唐太宗在洛阳宫初次接见玄奘,即为玄奘堂堂的仪表、豁达的风度、睿智的谈吐、渊博的学识所倾倒。他特别注意到向玄奘询问西域的情况时,玄奘都能有条不紊地一一作答,唐太宗兴奋地对大臣们说:“过去前秦符坚称道安和尚为神器,举朝尊崇。朕今观法师,词论典雅,节操高尚,风节贞峻,非惟不愧古人,亦乃出之更远。”而且他认为玄奘有辅国佐政的才能,故劝玄奘还俗,助理国务。玄奘婉谢道:“玄奘自幼出家,学习佛教内典,而不闻治国的礼教,今让我还俗,就如让水中之舟,离开水域,而就陆地一般,不但使其无用,而且使之徒然腐败罢了。”唐太宗遂安置玄奘到长安弘福寺翻译佛经。
贞观二十二年(648年)唐太宗到远离京师,有林泉山壑之美的宜君别宫——玉华宫避暑。他敕令玄奘也到玉华宫,在他政务之暇,相陪清谈。唐太宗对玄奘十分尊重,他曾赐给玄奘衲袈裟一件,制作极其精美。这件袈裟是后宫之人用数年的功夫,才作成的。据说在贞观十一年,唐太宗到洛阳宫。当时名声很大的苏州道恭、常州慧定,两位高僧被帝召见。二僧各披一衲,据说是当年梁武帝赐给他们师父的,其师又传给他们,故非常珍视,特意穿了来见皇帝。唐太宗笑其制作不精,并命取出宫人制作的这件袈裟让二僧看。二僧见其精美绝伦,都想得到它,但唐太宗却赐给他们每人五十匹绢。这件袈裟留存至今,才赐给了玄奘。
在玉华宫唐太宗与玄奘朝夕相处,聆听玄奘谈论深奥的佛教哲理,而不觉疲倦。唐太宗深深佩服玄奘学识精博,而再次向玄奘提出,国家大事十分繁重,不是帝王一人能担当得了的,必须有贤哲的群臣辅佐才行,故希望法师能脱僧还俗,参与国政。玄奘回答说:“陛下是英武圣明的皇帝,有平祸乱、安国家、措刑政、定边陲的文治武功。现在左右也不乏像伊尹、姜尚那样的贤哲,玄奘愚陋,怎能胜任政务,恳请陛下不要勉强我放弃守戒佛门,弘扬佛法的夙望。”唐太宗遂答应不夺其志。
唐太宗晚年崇信佛教,十分喜欢听玄奘谈玄讲经,以至不愿其暂离身边。唐太宗自玉华宫还京后,令在紫微殿西侧,建造一座弘法院,让玄奘居住。白天陪帝谈论,晚上还院翻经。贞观二十三年(649年)四月,唐太宗到终南山别宫——翠微宫,令皇太子李治和玄奘陪驾前往。同年五月唐太宗逝世于翠微宫的含风殿。所以直至唐太宗去世时,玄奘都是陪侍在其身边的,可见唐太宗对玄奘的器重宠信。