日本内阁官房长官松野博一在10月27日的记者会上，就中国前总理李克强突然逝世代表日本政府表示：“他在日中关系中发挥了重要作用，祈愿他安息，并表示深切的哀悼”。
李克强多次访问日本，在年轻时曾在原民主党代表小泽一郎家住过一段时间，他对日本的最后一次访问是在2018年5月，日中韩领导人峰会在日本举行期间。
2006年，当时日本最大的在野党民主党“三巨头”——党代表小泽一郎、代表代行菅直人、干事长鸠山由纪夫，于当年7月3日－6日访华，小泽在2006年7月5日访问完天津以后，作为个人行程，乘CA1655航班直奔沈阳，去见当时的辽宁省委书记李克强。
10月27日，现为立宪民主党众议院员的小泽一郎更新其X的内容，对于与他有多年亲密交往的中国前总理李克强在上海去世表示深切的哀悼。
他说：“听到李克强前总理突然去世的消息，我感到非常惊讶和深感悲痛。”“我和李克强前总理在我们还年轻的时候就开始交往，我们的友谊持续很长时间了，应我们主办的至诚基金的邀请，时任共青团书记的前总理李克强访问日本，在日本期间还在我岩手县的家里住过一段时间。”他还透露，他们两个家庭间的交往也很密切。
小泽一郎表示：从那时起，他一直作为党和政府的要人活跃在党和政府中，留下了伟大的政治遗产，这是有目共睹的。他还如此年轻就英年早逝，是中国国家的损失，对日中友好的发展也是巨大的损失，衷心祈念他的安息。
据日本《产经新闻》27日报道，在中国，日本NHK电视台海外新闻节目在播放李克强去世消息后，电视影像一时被遮断，取而代之的是彩条和屏幕显示“信号异常”的画面， 中国当局似乎采取了限制措施。
《产经新闻》指出：电视新闻中有关李克强存在感下降以及他辞去总理职务的经过等报道被删除。在中国，政治领导人的去世可能会导致对政府的批评增加，当局可能会对此保持高度警惕。