研究自动交易系统已有很长时间了，理论上，研制的系统肯定能赚钱，但在实际交易中却遇到许多问题，迟迟未能用于大规模的实战。
首先，实时数据的采集会出现问题。需要考虑当机，断线，数据误差，时差所带来的影响。
其次是交易单的执行问题。会出现Slippage，Spread，延迟，甚至不被执行等等情况。这些问题在系统的理论回测中都不会有，而在实际交易中却无法避免。
自动交易系统必须能容错，必须在出现一定错误交易的情况下仍然赚钱。程序必须能在无人看管的情况下，自动修正，维持系统的正确状态。为了达到这些目标，现在交易程序变得越来越复杂，又增加了程序维护更新的难度。
