公元659年年底，左骁卫大将军苏定方率军讨伐反叛的思结部落叛乱，并在马头川城下思结部落俟斤都曼，迫使他出降。
显庆五年即公元660年春正月，苏定方在乾阳殿献俘。法司请求杀了被俘的都曼，苏定方替他求情说：“臣答应他不死，都曼才肯出降。希望陛下赦免他的馀生。”唐高宗李治说：“朕为了保全爱卿的信誉，暂且违背了法律。”因此赦免了他。
正月十二（甲子），唐高宗离开东都，并于二月初九（辛巳）抵达并州。二月十四（丙戌），唐高宗宴请随从官员和亲戚，以及并州官属和父老，赐给他们不同数量的布帛。他还特赦并州及其辖下的各州。李渊当年举义时任职的五品以上官员，只要坟墓在并州的，唐高宗都让有司部门去致祭。佐命功臣的子孙以及大将军府僚佐以下还幸存的人，唐高宗也都赐给他们不同的官阶，量才叙用。他赐给参加晋州起义一品以下的官员不同数量的布帛；八十岁以上的老人也被授予名誉刺史或县令。他还给已去世的佐命功臣为父后的子孙各加两阶，同时让百姓欢宴三天。二月二十二（甲午），唐高宗到李家旧宅老祠堂祭祀，以武士彟、殷开山、刘政会为祖先配食。
三月初五（丙午），武皇后在并州的朝堂宴请亲戚故旧以及邻里，并在内殿招待妇人，还下制，给皇后故乡的并州长史和司马各加一级；皇后直系亲属每人赐给一千段布帛，服丧一年的期亲五百段，大功以下以及五服以外的远亲和邻里故旧也赐给不同数量的布帛。她还下诏说：“八十岁以上的并州妇人，用绵版授予她们郡君的身份。”
三月初八（己酉），朝廷在并州城西举行军事演习。唐高宗登上飞阁，请群臣一道临场观赏。
百济仗恃高丽的支援，多次入侵新罗。新罗王金春秋上表求救。三月初十（辛亥），唐高宗任命左武卫大将军苏定方为神丘道行军大总管，统领左骁卫将军刘伯英等水陆十万大军讨伐百济；任命金春秋为嵎夷道行军总管，率领新罗的部众，和苏定方合势。
三月十六（丁巳），朝廷首次将左右领改名为左右千牛。
夏四月初七（戊寅），唐高宗离开并州，并于四月二十二（癸巳）回到东都。五月，朝廷开始在东都苑内兴建八关宫。五月二十二（壬戌），唐高宗临幸八关宫，并将它改名为合璧宫。
五月二十八（戊辰），朝廷任命定襄都督阿史德枢宾、左武候将军延陀梯真、居延州都督李合珠共同担任冷岍道行军总管，各自带领所部出兵讨伐反叛的奚族人，还命令尚书右丞崔馀庆充当使臣，总监护三部兵马。奚族人不久就派使者前来投降。朝廷改派阿史德枢宾等人为沙砖道行军总管，出讨契丹，并很快就生擒了契丹松漠都督阿卜固，然后将他押送到东都。
六月初一（庚午），日食。六月二十二（辛卯），唐高宗下诏，让五品以上文武官员以四科标准举人（举荐人才）。六月二十五（甲午），御驾回宫。
前太子房州刺史梁王李忠年龄渐长，颇不自安，有时私下会穿上妇人的衣服以防备刺客；又多次自己占卜吉凶。有人告发了他的行为。秋七月初六（乙巳），唐高宗将李忠废为庶人，流放到黔州，囚禁在前太子李承乾的故宅。
七月二十八（丁卯，《旧唐书》作次日的戊辰），度支尚书、同中书门下三品卢承庆因为费用调度失当而被免官。
八月，吐蕃禄东赞因为吐谷浑内附唐朝，派他儿子起政带兵出击吐谷浑，。
再说，苏定方率军从成山跨过大海，百济人占据熊津江口抗拒唐军。苏定方进击打败了他们，百济人阵亡了数千人，其余全都溃散跑走。苏定方水陆并进，直趋他们的都城。在离都城二十多里地时，百济人倾国来战。苏定方击溃他们，杀了一万多敌兵。百济的残兵逃进了城郭。百济王扶余义慈和太子扶余隆逃到北边，苏定方进围了都城。扶余义慈的次子扶余泰自立为王，率众固守。扶余隆的儿子扶余文思说：“国王和太子都在，而叔父就匆忙拥兵自立。假如他真能击退唐兵，我父子必将没命了。”于是带领身边的亲信逾城出来投降，百姓也都跟从他出降，扶余泰不能禁止。八月十二（庚辰），苏定方命令军士登上城墙，树立大唐旗帜。扶余泰的处境窘迫，只好开门请求饶命。于是扶余义慈和太子扶余隆以及其他诸城城主也全都投降。百济原来有五个部落，分别统辖三十七个郡、二百座城池、七十六万户人口。唐高宗下诏在百济的地盘设置熊津等五都督府，任命百济的酋长为都督或刺史。朝廷还特赦神丘道和嵎夷道总管辖区，并因此赐天下人欢宴三日
八月十四（壬午），左武卫大将军郑仁泰带兵讨伐思结、拔也固、仆骨、同罗四个部落，三战皆捷，追杀了一百多里，杀了他们的酋长后凯旋而归。
九月二十（戊午），朝廷赐给英国公李世勣一座墓地。
冬十月，唐高宗开始患凤眩头重症，眼睛看不清。百司奏事，他有时让武皇后决断。武后生性明敏，涉猎文史，处理政事全都让唐高宗称心如意。于是唐高宗开始将政事委托给她，因此武后的权柄相当于君主。
十月初九（丙子），武后的母亲代国夫人杨氏改为荣国夫人，品秩第一，位在王公的母亲和妻子之上。
十一月初一（戊戌），唐高宗登上则天门楼，接受百济王扶余义慈和太子扶余隆等五十八名战俘，并在责备后将他们全都释放了。邢国公苏定方先后消灭三国，全都生擒了他们的君主。朝廷为此大赦天下。
十一月十七（甲寅），唐高宗临幸许州，并于次日在许州和郑州的郊区狩猎。十二月初五（辛未），唐高宗到长社狩猎，并于十二月十三（己卯）回到东都。
十二月十六（壬午），唐高宗任命左骁卫大将军契苾何力为浿江道行军大总管，左武卫大将军苏定方为辽东道行军大总管，左骁卫将军刘伯英为平壤道行军大总管，蒲州刺史程名振为镂方道总管，带兵分道出击高丽。青州刺史刘仁轨因为负责军需的海运，结果船只在大海沉没，被免职，以白衣从军赎罪。
翌年即公元661年春正月十九（乙卯），朝廷招募河南河北以及淮南的六十七州兵马，得到四万四千多人，将他们送到平壤和镂方两大行营。正月二十二（戊午），朝廷任命鸿胪卿萧嗣业为夫馀道行军总管，率领回纥等各部落的兵马前往平壤行营。
二月三十（乙未晦），因为益、绵等州都声称有龙出现，唐高宗改元为龙朔，并特赦洛州。
三月初一（丙申），唐高宗和群臣以及外夷在洛城门城楼举行宴席，观赏屯营新教的称为《一戎大定乐》的舞蹈。当时唐高宗想亲征高丽，所以用这舞蹈象征用武的势头。
当初，苏定方征服了百济后，将郎将刘仁愿留下镇守百济府城，又任命左卫中郎将王文度为熊津都督，安抚剩馀的百济部众。王文度不幸在跨海时死去，百济的僧人道琛和故将福信聚众占据周留城，然后从倭国将前王子扶余丰迎接回国，接着带兵把刘仁愿包围在府城。朝廷下诏起用刘仁轨检校（代理）带方州刺史，带领王文度的部众，并顺道征发新罗兵马，去救刘仁愿。刘仁轨喜出望外地说：“上天将让老翁富贵起来了！”并到州司那里请求得到《唐历》以及大唐宗庙的名讳，要带上它们出行，还说：“我想扫平东夷，将大唐的正朔颁布到海外！”刘仁轨御军严整，转战而前，所向无敌，攻下了沿途的城池。百济人在熊津江口建立了两座栅寨，刘仁轨和新罗兵马合力进击，打败了他们。百济士兵阵亡和溺死的多达一万馀人。道琛等人只好放弃了府城之围，退保任存城。新罗军队的粮食用尽，只好撤退回去。道琛自称领军将军，福信自称霜岑将军，招集徒众，于是势力更加增强。刘仁轨的部众人少，只好和刘仁愿合并，让士卒得到休息。他接着上表要求朝廷下诏命令新罗出兵。新罗王金春秋奉诏，派他们的大将金钦带兵去救刘仁轨他们。新罗大军到了古泗，遭到福信的袭击，战败了。金钦因此从葛岭道逃回新罗，不敢复出。福信不久就杀了道琛，专权总领百济国的兵马。
夏四月初三（丁卯，《旧唐书》作五天前的壬戌），唐高宗临幸合璧宫。
四月十六（庚辰，《旧唐书》作五月初二丙申为误），唐高宗任命兵部尚书、同中书门下三品、乐安县公任雅相为浿江道行军总管，左骁卫大将军凉国公契苾何力为辽东道行军总管，左武卫大将军邢国公苏定方为平壤道行军总管，与萧嗣业以及各路胡人兵马，总共三十五军，水陆分道并进。唐高宗想亲自带领大军继发。当天，皇后请求禁止天下妇人演出俳优之戏，唐高宗下诏同意了。四月二十九（癸巳），皇后上表谏止唐高宗亲征高丽，唐高宗下诏听从了她的建言。四月三十（甲午晦），日食。
六月十八（辛巳），太白经天（白天见到金星，认为是凶兆）。
六月二十（癸未），朝廷在吐火罗、嚈哒、罽宾、波斯等十六国的地盘设置八个都督府，七十六个州府，一百一十个县衙，一百二十六个军府，全都隶属安西都护府。
六月二十七（庚寅），中书令许敬宗等人呈上《累璧》六百三十卷，目录四卷。
秋七月初十（癸卯），唐高宗的御驾回东都。
八月十二（甲戌，通鉴作七月为误），苏定方在浿江打败高丽，接着屡战皆捷，进而包围了平壤城。
八月二十四（丙戌），朝廷下令，让全国各州举荐孝行尤其显著以及多代同居和可以鼓励良好风俗的人。
九月初一（癸巳），特进新罗王金春秋去世。唐高宗封他儿子金法敏为乐浪郡王和新罗王。
九月十二（甲辰），河南县妇女张氏一百零三岁，唐高宗为此亲自临幸她的宅第，同时也临幸了李世勣的府第。天宫寺是唐高祖李渊尚未起兵时的旧宅，唐高宗在那里仔细观看了殿宇，感叹了很久，还让二十个僧人为祖上的亡灵超度。皇后也来到散骑常侍许圉师的府第（《新唐书》作前一天癸卯）。
九月二十（壬子），唐高宗改封潞王李贤为沛王。李贤听说王勃擅长写文赋，便召他为修撰。王勃是王通的孙子。当时诸王喜好斗鸡，王勃信手玩笑地写了篇《檄周王鸡文》。唐高宗看了这文赋后，非常生气，说：“败坏风俗就是从这样的小事开始的。”于是将王勃赶出了沛王府。同一天，唐高宗任命雍州牧、幽州都督、沛王李贤为扬州都督、左武候大将军，保留雍州牧；任命洛州牧、周王李显为并州都督。当天，他还下敕，让中书门下五品以上的各司长官、尚书省侍郎，以及三等以上的皇亲，都前往沛王的宅第，出席朝廷为他安排的宴礼（根据《左传·宣公十六年》，天子招待诸侯为享礼；招待诸侯的卿为宴礼。但这里的沛王应算是诸侯而不是卿），并奏《九部乐》。宴礼完毕后，还赐给宾客不同数量的布帛杂彩等物品。
高丽权臣泉盖苏文派他儿子泉盖男生率领精兵数万守卫鸭绿水，大唐各军无法渡过。契苾何力到时，正值河冰冻得十分坚硬，于是他率众利用坚冰渡过鸭绿水，击鼓呐喊，奋勇前进。高丽兵马全线溃退，契苾何力率军追杀了数十里，斩首三万级，泉盖男生的残余部众全都投降，他自己仅仅逃得性命。刚好朝廷有诏令他班师，契苾何力于是撤军回来。
冬十月初五（丁卯），唐高宗到陆浑围猎，接着又于十月初六（戊辰，通鉴作戊申为误）到非山狩猎；并于十月十一（癸酉）回东都。
同时，回纥酋长婆闰去世，他侄儿比粟毒代领他的部众，与同罗和仆固两部落侵犯边境。唐高宗下诏，任命左武卫大将军郑仁泰为铁勒道行军大总管，燕然都护刘审礼和左武卫将军薛仁贵为副手，鸿胪卿萧嗣业为仙萼道行军总管，右屯卫将军孙仁师为副手，带兵讨伐这些铁勒人部落。刘审礼是刘德威的儿子。
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