1947年4月，萧克（左一）与聂荣臻、杨成武在正太战役前线。
1972年5月，萧克被任命为解放军军政大学校长
1975年7月30日，萧克（右二）陪同叶剑英、徐向前接见中国人民解放军军政大学学员。
叶剑英为军事科学院院长政委，粟裕副院长（上图右四）。
1977年，改任国防部副部长兼军事学院院长、第一政委
20世纪60年代,毛泽东与萧克亲切握手。
为何是便装？因为此时，肖克是农垦部副部长，脱下了军装。
在1958年的军队“反教条主义运动”中，时任国防部副部长、解放军训练总监部部长的萧克上将受到错误的批判，被撤销在国防部、训总的职务。1959年9月，萧克被安排到农垦部当副部长，在农垦系统度过了12年不平凡的岁月，也用实际行动践行了一名共产党员对党的忠诚。
1959年5月，中央批转了总政关于“反教条主义”的报告后，对萧克的批判基本上结束，但此时萧克在军队的职务已被撤销，赋闲家中。当贺龙、王震、张子意、张启龙等红二方面军的老领导、老战友来看他时，他表明自己的态度：“我是共产党员，永远不会消极。”
时任农垦部部长的王震和萧克是老战友、老搭档。红军时期，萧克是红六军团军团长，王震是政治委员，两人并肩指挥作战。除了关心萧克的境遇外，王震还对其今后去向提出了建议：“黑龙江垦区准备建一个水库，正缺少人手，我给省委书记欧阳钦打个电话，你去那里建水库怎么样？”萧克满口答应：“行，干什么都行。”萧克早年在中央苏区时就与欧阳钦相识，欧阳钦也表示欢迎萧克来黑龙江工作。
1959年9月，萧克接到中央的通知去农垦部当副部长。穿了一辈子军装，一旦脱下来，不免有些感伤。
国庆节一过，萧克便以积极乐观的心态来到农垦部上班。
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1971年九一三事件后，萧克的境遇得到改善，他被通知参加干校党的核心小组扩大会议。
1972年1月16日，他得到一个让他激动不已的通知，农垦部党的核心小组决定恢复他的组织生活。
又过了20天，校部来电话通知萧克返回北京，他又惊又喜，追问一句：“带不带东西？”对方答：“带，全带上！”他明白了。
回京后，萧克住在夫人蹇先佛所在水电部的宿舍里。4月20日，主持军委日常工作的叶剑英找他谈话，军委决定他任解放军军政大学校长。萧克又重新穿起了军装，重返军队。自此，他也结束了长达12年的农垦生涯。
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有两个说法：
毛泽东曾说‘萧克这个人在历史上一贯不正派。’
毛泽东曾说： ‘肖克是坏人’。
这两句话，均不见可靠可信的时间地点人物，是怎么说的。存疑。
另说：
1959年国庆后，肖克被任命为农垦部副部长，做了老搭档王震的副手。这段时间，肖克下去调研、搞农垦规章制度，远离越来越波诡云谲军内斗争，倒也是因祸得福。
文革爆发后，肖克又卷入了一次漩涡。当时农垦部始终没有大字报针对部长、副部长。不久，负责农林口的国务院副总理谭震林要求部长王震去湖南“养病”。王震刚一离京，谭震林就找代理部长的肖克谈话，“启发”肖克去贴王震的大字报。也不知为什么肖克就答应了，很快召开了部里的党组扩大会议。在会上，肖克说：王震不在家，并不影响对他的揭发。现在背靠背，将来面对面。。。。。。现在部内可以放手批判王部长，可以出他的大字报，请大家放手批评。各局回去以后和大家讲一讲。必要时，还可以把王震叫回来。
在短短的40天时间里，农垦部接连召开了18次党组扩大会缺席揭发王震，贴了他的大字报。结果，农垦部陷入混乱，王震成为了文革开始后第一个被揭发批判的部长。王震回到北京以后，又遭到了部内造反派的连续冲击。王震怒不可遏，也连续贴出了大字报予以回击。他把肖克的历史上的一些问题揭发出来，从二、四方面军会师到1958年反教条主义等等，一时广为传抄，令肖克非常尴尬。
一对曾经出生入死的老战友就此交恶。
运动持续深入后，肖克也难逃噩运，遭到批斗，被关进“牛棚”隔离审查。1969年12月，肖克又被下放到江西“五七干校”接受再教育，一呆就是2年多。1972年初，林彪倒台后，肖克才被调回北京担任解放军军政大学校长。肖克与政委唐亮尽力从全军各处抽调回了上百名教员，重新开始了全军最高学府的军事课程教学。肖克所说的一生中“第三次站错队”，就是指文革期间。
