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传统中医产生于原始社会。春秋战国时期，中医理论已经基本形成，出现了中医解剖学和医学分科，加上源自大自然的药材与与源自天人合一的药理，逐渐完善了传统中医的理论基础。
传统中医是以天人合一的三个哲学观（即整体理念、辨证论治、循证医学）为最大特色的中传统医学体系的基础与核心。中医基础理论的学说主要包括分形阴阳五行学说、脏象五系统学说、五运六气学说、气血精津液神学说、分形经络学说等五大学说，其中以脏象学说（中医解剖学）为核心，信息－能量－物质学说（超微观量子医学）为基础，分形经络学说为实践指南。
1，分形阴阳五行学说：中国古代哲学的基础。（1）分形观（相似观），是通过取象比类，取数比类等等方法，运用类比、象征的方式，把握对象世界联系的思维方法，运用带有感性、形象、直观的概念、符号表达对象世界的抽象意义；（2）阴阳观，是通过对矛盾现象的观察，逐步把矛盾概念上升为阴阳范畴，并用阴阳二气的消长来解释事物的运动变化。中医运用阴阳对立统一的观念来阐述人体上下、内外各部分间，以及人体生命同自然、社会这些外界环节之间的复杂联系；（3）五行观，是用木、火、土、金、水五个哲学范畴来概括客观世界中的不同事物属性，并用五行相生相克的动态模式来说明事物间的相互联系和转化规律。分形阴阳五行学说的弊端：具有较强的主观性，是中医里面唯一被逐渐淡化的领域，现代中医保留的是其中模糊医学的多维思想。
2，脏象五系统学说：包括心系统、肝系统、脾系统、肺系统、肾系统。脏象学说主要研究五脏（心、肝、脾、肺、肾）、六腑（小肠、大肠、胃、膀胱、胆、三焦）和奇恒之腑（脑、髓、骨、脉、胆、女子胞）的生理功能和病理变化，其实就是中医解剖学。与西医的机械解剖学相比，中医解剖学借助肌体的自然物理信息的动态变化，可以精确到不可见的超微观量子形态；中医解剖学揭示的是人与自然的动态关系，关注的是生命全息的动态平衡。因此，中医解剖学又称信息解剖学，是超越西医机械解剖学的最伟大发现。
3，五运六气学说：是研究、探索自然界天文、气象、气候变化对人体健康和疾病的影响的学说。五运包括木运、火运、土运、金运和水运，指自然界一年中春、夏、长夏、秋、冬的季候循环。六气则是一年四季中风、寒、暑、湿、燥、火六种气候因子。运气学说是根据天文历法参数推算年度气候变化和疾病发生规律。在人类影响大自然和人类生活方式越来越严重的当今社会，五运六气学说也在发生变化，并有更科学更自然的诠释：顺应自然的发展规律，而非顺应自然。
4，气血精津液神学说：又称信息－能量－物质三元学说，既是脏腑经络及组织器官生理活动的产物，又是脏腑经络及组织器官生理活动的物质基础。在气血精津液神六大物质系统中，气是第一位的。人类与一切生物具备的生命能量或动力，以及宇宙间的一切事物，均是气的运行与变化的结果。中医学认为，气是人体的第一道防护线，聚于体里保护着脏腑，而流散发于肤表以防外邪侵入而导致疾病发生。人体生命从受精卵开始，到其出生长大成人并直至其死亡化为泥土，它没有消耗过一个原子（或物质），其消耗的只是以物质为载体所携带的生物能。人体生命一生的变化，主要是其能量的变化，而物质只是能量运动的载体，其在某一点或“横截面”上显现的变化只是能量运动的一种表现形式，支撑并主导物质变化的是隐藏在其背后不予显示的能量变化。这一学说是当今生命科学与人体医学中最接近生命本质的真理。
5，分形经络学说：是研究人体经络的生理功能、病理变化及其与脏腑相互关系的学说。其中主要有十二经脉、奇经八脉、十五别络，以及从十二经脉分出的十二经别。人体内运行气血的通道，有沟通内外，网络全身的作用。在病理情况下，经络系统功能发生变化，会呈现相应的症状和体征，通过这些表现，可以诊断体内脏腑疾病。中医临床治病明辨病变的脏腑经络，把握疾病的传变，以及中药方剂的归经理论等，都以经络学说为基础。《黄帝内经》里面一个重要的概念贯穿于全书，那就是经络。气血运行乃是经络系统最主要的功能，以此实现人体整体的物质与能量交换。经络系统是起源最古老、系统最完善、流传最悠久的一个人体能量系统（起源于5万年前），是现代能量医学的鼻祖。
最后的结论：传统中医的理论基础仍需要不断发现、扬弃、提取、发展。
