第一舰队
第一舰队属闽系旗下，为中央海军（指闽系）唯一能出远洋的舰队。曾巡游英国日本。1934年宁海舰参加东乡元帅葬礼驶入日本横滨港时，因与早年访日的定远舰一样两舷晒满被单衣物而被日本媒体大肆嘲讽。除宁海、平海、逸仙三舰外，其余均为清末建造的老旧废舰，其中海筹、海容、自强、大同均于1937年八月十二日起在长江江阴自沉。
第一舰队属舰：
轻巡洋舰：宁海、平海
废旧驱逐舰：大同、自强
海防炮舰（巡防舰Frigate，中国称之为“巡洋舰”）：逸仙
老巡洋舰：海容、海筹
炮舰：永健、永绩、中山、建康
运输舰：定安、克安
第二舰队
第二舰队属中央闽系旗下，主要用于巡防长江、上海及华南沿岸。要为小船老舰，战力平平。
第二舰队属舰：
浅水炮舰：民权、民生、咸宁、楚同、楚泰、楚有、楚观、楚谦、江元、江贞、江鲲、江犀
鱼雷艇：湖鹏、湖鹗、湖鹰、湖隼
练习舰队
练习舰队属中央闽系旗下，主要用于马尾海校学员作远洋训练之用。旗下各舰均为清末建造的非正式军舰。
练习舰队属舰：
练习巡洋舰：应瑞、通济
巡防艇队
巡防艇队属中央闽系旗下，主要用于巡防重庆至武汉地区长江航线，旗下各舰主要为北伐前南方各军阀所建的小型炮舰及武器禁运时期（1919年～1929年）末期征用了江轮加装火炮改装成的的代用炮舰。
巡防艇队属舰：
巡防艇：顺胜、勇胜、义胜、仁胜、海宁、江宁、抚宁、绥宁、肃宁、威宁、崇宁、义宁、正宁、长宁
测量队
测量队属中央闽系旗下，主要用于长江航线港务之用。
测量舰艇：甘露、皦日、青天、武胜、诚胜、公胜
第三舰队
前身为原北洋政府的东北海军及渤海舰队，九一八事变后因渤海派与东北派的内斗造成东北舰队从此一蹶不振被中央（指蒋中正的中央政府）收编为第三舰队。1937年中日战争爆发后于十二月十八日全部自沉于青岛与威海卫阻塞航道。
第三舰队属舰：
水上机母舰：镇海
旧驱逐舰：同安
炮舰：永翔、楚豫、江利
运输／布雷舰：定海
广东江防舰队
广东（粤海舰队）与东北海军（第三舰队）一样直属军政部，不受中央闽系海军部管辖。因为任务以珠江和沿海缉私捕盗为主，兼且受限于财力，广东舰队只能以数量计颇为可观，但吨位都极小的小型浅水炮舰与鱼雷艇为主。舰小质差却量多是广东舰队的一大特色。
广东江防舰队属舰：
炮舰：海周、海虎
运输舰：海瑞、福安
练习巡洋舰：肇和
浅水炮舰：海强、海继、江大、江巩、广金、广澄、安北、舞凤、坚如、执信、湖山 、光华、智利、金马、飞鹏、江澄、江平、平西、靖东、广安、广原、利琛、浽江、海鸥、珠江、西兴、仲元、仲凯、新松江
鱼雷快艇：快艇大队（超轻型鱼雷快艇）：快艇一号、快艇二号、快艇三号、快艇四号
电雷学校快艇大队
1932年，当时的军事委员会委员长蒋介石为了想要建立一支将来能与闽系（马尾派，即当时称为“中央海军”的海军部与所辖第一、第二舰队）抗衡的嫡系海军，委由欧阳格在江阴创立了电雷学校。电雷有一特色，即他不但是军校，也是战斗部队；因为他辖有一个鱼雷快艇大队与一批练习舰艇，俨然一支独立的小型海军。
电雷既然意在培养非闽系的海军干部，当然倍受旧海军之排挤；电雷不隶属闽系把持的海军部而直属军政部，而海军部也不承认他们是海军，双方斗争激烈。电雷自称是“海军的黄埔军校”自是受到当局的特别照顾，电雷毕业生来台后许多位居海军要津，但他们在抗战当时却是非常吃憋的。
另外，电雷学校与中央政府内政部所属浙江海警局关系非常密切，不少电雷学校属舰均借自浙江海警局。
电雷学校快艇大队属舰：
鱼雷快艇文天祥中队（超轻型鱼雷快艇）：文42、文88、文93
鱼雷快艇史可法中队（超轻型鱼雷快艇）：史34、史102、史181
鱼雷快艇岳飞中队（大型鱼雷快艇）：岳22、岳253、岳371
布雷／巡逻炮舰：海静
旧式（前清遗留）炮舰：钧和、策电、伯先
浅水炮舰／运输舰：同心、同德
远航练习舰：自由中国
布缆拖艇：俞大猷
驳艇：零一号、镇海
抗战前中华民国海军总吨位：3万8千吨
