1901年夏天，戴德生的身体稍为好转，有足够体力往白朗峰（MontBlanc）山脚的沙木尼谷（Chamonix Valley）一行。但他散步于丛林中时，不幸在松叶上滑了一跤，引起脊椎旧病复发，不得不又有好几个月关在房间里。病愈后，他回到英国住了几个月，并参加纽恩登林荫路内地会各项的活动。
1902年5月，在他的七十大寿之前，他又回到瑞士。他和珍妮住在日内瓦湖的北边。在翠华岭（Chevalleyres）的小村庄里’即维薇镇（Vevey）以北二哩的草地和果园中间，他们租了一栋房子，内有会客室和一个卧房，并且有露台和阳台，朝着东面升起的太阳。租金包括每天送来的膳食。他们每天四处漫步，很快结识了许多朋友，上至住在白朗尼（Blonay）的中世纪城堡里的伯爵和伯爵夫人，下至当地的小地主，以及住在木屋中的居民。不久，正如戴德生的儿子和媳妇所描写的，翠华岭就成了群山之间的「内地会中心」了。
韦达（Robert Wilder）是美国的学生领袖，他来此地居住了六个月。他告诉戴存义夫妇说：「与你父亲交谈倒不觉什么’但你父亲本人却真不简单。遇见他真是我毕生大幸。他身上带着耶稣基督的香气。他那坚固的信心，泰然自若的神态和永远不懈的勤奋，即使在身体十分衰弱的时候，还是一样。这都深深感动了我。他曾是那么热心，现在年老体弱，不得不过退休的生活。每次祷告都不能超过十五分钟。但他仍然头脑清晰，充满喜乐，实在使我印象难忘，我记得他说过：『如果是神容许我离开事奉的岗位，我肯定不表异议。』他的口里从来没有一句怨言。他整天都那么喜乐——白天陶醉在芬芳的花群中，夜间则欣赏闪烁的繁星。」
戴德生和珍妮多么愿意享受长相厮守之乐。他们在婚后多次不得不因为工作而长时间分离，现在日夜相对为伴是多么的快乐。戴存义夫妇回想这对身体衰弱的夫妻一起乘火车或船出外时，说：「虽然结婚已久，他们依旧是一对情侣。J他俩手挽着手缓步走向山上风景优美之处，一同欣赏大湖美景和阿尔卑斯山的壮丽。戴德生再次重拾旧日摄影的嗜好，而且花很多小时禾自己冲晒底片；他又用许多时间观赏花木，这股热情还是六十五年前从他父亲那里感染过来哩！
自从他的健康崩溃后，他的精神不能集中，只可读点消闲刊物、信件以及那本天天为伴的书；他读圣经，四十年读了四十遍，同时对照法文译本，得着新的亮光。
尽管他已经委任何斯德为内地会的署理总主任，但他自己仍保留着总主任的头衔，并且定期收到何斯德和范约翰寄来的汇报。但当1902年11月何斯德到瑞士访问他时，戴德生决定将内地会总主任一职完全移交给他，这安排已经取得其它主任及委员们的同意。委员之一的伊荣说：「我感到非常高兴，因为你挑选了一位很可能是我们当中最懂祷告的人。」
1903年7月，戴德生发现六十岁的珍妮体内长了一个肿瘤。由于她母亲是患癌症去世的，故此戴德生有点担心，就给儿子拍了电报。戴存义夫妇于是赶到翠华岭，并请了一位国际有名的癌病专家，对珍妮作彻底检查。
这位名医对戴存义说：「不错这是癌症。而且病情已经扩散，我担心手术也救不了。」戴德生和珍妮都没有详细追问检查后的结果。因为不必动手术，所以他们认为这不过是普通的肿瘤而已。由于他俩不追问，所以也没有人把真实的病情告诉他们。
这年冬天，戴德生夫妇在洛桑度过，那儿附近有一位著名的医生，也有一间英国人的教会。到了1904年春天，珍妮的身体更虚弱，他俩回到翠华岭，在那里欣然听到中国得救的人数增加了。珍妮愈来愈瘦，戴德生自己也很虚弱。但他俩很高兴地一起静坐在阳台观看草地上长着水仙花和琉璃子，以及盛开的樱花，也欣赏林中鸟儿的啼叫。
六月，戴存义又到了翠华岭；几天后，珍妮的二十八岁女儿艾美（Amy）也来了。六月以后，珍妮衰弱到连穿衣服的力量也没有。但因为房间的窗户是法国式的，向着阳台敞开，她在室内也能享受优美的景色和新鲜的空气。
她告诉一位朋友：「我所受的照顾是最好的，我也快乐得很。我马上要回家了。不知家里的情景怎样！主正慢慢地、温柔地接我回去！」
在写给媳妇的便条中，她说：「你该知道存义是我极大的安慰，艾美和爸爸也是。他们都是那么可爱，在各样事情上宠爱着我。我们的主待我们是那么温柔和慈祥，所以我别无所求，只有赞美！」
7月29日晚上，珍妮感到呼吸困难，戴德生坐在她旁边。
她一直在说：「不痛，不痛。」
次日黎明前，她对戴德生低声说：「求主快点把我接去吧！」
他犹豫了一下，然后祷告说：「亲爱的父啊！求称释放她那等候的灵。」
五分钟后，祷告得蒙应允。
他们把珍妮葬在赖采塞斯（La Chiesaz）教堂后的墓地，让她安息在红叶攀藤的灰色古塔荫下。戴德生常常两手捧着献给珍妮的鲜花，走过白朗尼城堡，来到这座教堂，坐在杉树下观看湖光山色，有时含着满眶泪水。
珍妮死后数星期，戴德生从家中会客厅墙上挂的一句法文金句中得到安慰：
「因为那应许我们的是信实的。」
（Celui qui a fait les promesses est fidele）
当1905年春天来临时，戴德生感到他的健康状况已经可以应付往中国作第十一次探访了。他的儿子存义和媳妇跟他一起去，途经美国，至4月17日在上海泊岸，然后在扬州过复活节。三十七年前，戴德生和玛莉亚在这里经历暴乱，得神保守逃过大劫。
在镇江，戴德生独自在河边的墓地漫步，那儿埋葬了玛莉亚和他的四个孩子。
在一批年轻的宣教士出发到内地的布道所之前，戴德生对他们说：「我很荣幸能在此跟你们见面。在过去的年日中，我在此会见过许多人。我的爱妻也在此地去世。在灵里面，我们所爱的人和我们极其亲近，远比我们所想的还要近；他也在灵里与我们极其亲近，超乎我们所想象的。我们的主耶稣从不离弃或撇下我们。就让我们依靠他、享受他、住在他里面。亲爱的朋友，务要向他和他的道尽忠。他永不叫你的盼望落空。」
1905年4月29日，汉口有三位在中国传道多年的「老兵」一起在伦敦会的杨格非（Griffith John）家里聚会。幸而有人想到拍照留念。三位长者都蓄着长长的胡子和穿着厚厚的大衣。丁题良（W．A.P.Martin）博士，年七十八岁，是美国长老会牧师，也是神学博士，他坐在一盆棕树的旁边。他在五十五年前已来到中国。杨格非博士，年七十三岁。他在中国也经历了半个世纪。而年纪最幼的戴德生，七十二岁，坐在一张帆布椅上。杨格非年纪虽老，但还是充满威尔斯人的气魄和热情，和戴德生一起唱着赞美诗。
然后，戴德生跟儿子和媳妇一起乘火车北上河南，只花几小时就到达了。回想十一年前，他们乘独轮车，要花上两个星期才到达哩！他们一行三人，探望了河南七个内地会的布道所。在其中一间教会里，中国基督徒为他庆祝七十三岁生辰，送他一面鲜红色的软缎旗，上面写着：「人所爱戴」。他们回到汉口时，是5月26日，正是「兰茂尔号」启航中国的三十九周年。
5月29日星期一，戴德生和儿子、媳妇，还有金伟飞（WhitfieldGuinness）和沙德宝姑娘（Sandebefg，她来自瑞典，她的家曾经接待戴德生）乘汽轮到湖南省的首府长沙。戴德生以往从没有到过长沙。但他听闻湖南是排外情绪最厉害的省分，在前八、九年内，从未有一个传教士获准留下传道，但现在却有来自十三个宣教差会的一百多名传教土，他们和中国信徒一同合作，在那里开展工作。
他们的汽轮向西南而行，横过洞庭湖，一直下到湘江。船上只有他们是外国人。当时十分炎热，他们常在甲板上纳凉。最令人兴奋的是数天之后，金伟飞和沙德宝姑娘宣布订婚。
在长沙，戴德生爬到城墙最高处的一座楼台上，了望湖南群山、湘江流域及其下游各城市。他们也视察了巡抚拨给内地会兴办医院的地点。
6月3日星期六，来自长沙六个不同宣教团体的传教士，齐集于内地会的会所，参加戴德生的欢迎会。他们都要来见这位拥有八百名传教士的内地会总主任。会客室的门通往一块大草地，四周遍植各种花木。他们在这里举行茶会。戴德生穿着一身山东的丝绸衣服，跟来宾会谈了一个小时。海勒医生（Dr．Frank Keller）特别注意到戴德生脸上那种单纯和喜乐的神态。
最后一位客人告别之后，戴存义劝他父亲上楼休息一会。住在这屋内的一位内地会传教士巴利医生（Dr Barrie）陪着他上楼。他们谈了一会，戴德生站起来伸手拿了两把扇子，一把递给巴利。
「哦！你为何不叫我拿来给你？」巴利问。
「我是想拿一把给你。」戴德生回答。
他们的话题转到祷告上去了。
「在祷告中，把一切都交托给神，这是我们最大的权利。」巴利说：「但我有时犹豫，感到有些事情实在太微小，不必祷告。」
「我并不以为然。在我看来，没有什么大事与小事之分。只有神才是伟大，我们应当完全信靠他。」
后来，戴德生在他房间里用晚餐。他的媳妇乐婷独自站在屋顶天台上，观看夜幕低垂后，长沙城中闪闪的灯光。之后，她下去看看房里的戴德生。
戴德生躺在床上，侧身挨着一张椅子，椅上点着一盏油灯，放着一堆信。他显然正在读信。乐婷调整一下他的枕头，坐在他旁边的椅子上。他没说什么，所以她开始谈到摊开在床上的《宣教评论》（Missionary ReView）里刊载的一些图片。忽然间，戴德生转过头来，抽搐一下，就不省人事了。乐婷看到这个情景，立刻奔到门口大声喊叫。
「存义，海勒医生！快来呀！」
海勒医生先到，及时看见戴德生颓然倒在他的枕头上，他的呼吸已经停止，他的脸色也变了。在乐婷看来，这位中国人的挚友就象小孩子般安详地睡着了。
一位年轻的中国传道人和他十八岁的新娘子，正在读戴德生所著（回忆录）（Retrospect）的中译本。他俩很想见见这本书的作者。他们来到长沙的内地会，便听闻这个噩耗。但他们特别获准围在戴德生的床边。
那位年轻的传道人问：「我可以摸摸他的手吗？」
他就握在戴德生的手，说：
「我所敬爱的牧长，我们真真实实爱戴你。今天我们来看你，渴望见到你的慈颜。我们都是你的子女，你为我们开拓了天家之路。多少年来，你爱我们，为我们祷告。今天我们来看你的慈容。你是那么快乐，那么安详。你正含笑，你的神情安静而喜悦。今晚你不能对我们说话。我们并不求你回到世间来，但我们会追随你，到你那里去。你将在那里迎接我们。」
当地的中国信徒坚持要买最好的棺木。他们把他抬到湘江边停泊着的一艘船上。船长下令扯下半旗，使船朝东北驶人宽广的长江。每当船停泊下来，就有许多人把鲜花和花圈送上船。所以，当范约翰在镇江迎接这船时，只见满船花簇，灵柩已埋在大堆七彩的鲜花中了。主持葬礼的是何斯德。遗体就埋在玛莉亚和四个孩子旁边。
1988年，戴德生的曾孙戴绍曾（Jim Taylor）在镇江昔日英国领事馆遗址发现记念戴德生的碑石，该址现已改成一所博物馆了。碑文还是完整无缺，写着：「恭敬纪念令人尊敬的中国内地会创办人戴德生牧师。生于1832年5月２１日，死干1905年6月3日。他一生常在基督里。」
