他1959年出生,曾就读于美国哈佛大学和安默斯特学院(Amherst College)。1999至2004年担任萨尔瓦多总统,任内推行新自由主义经济政策。实现本国货币的美元化。
卸任后,2013年开始受到洗钱和贪污的指控,其中2001年因灾收到陈水扁政府的1500万美元捐款,检察院称,经查证,1000万转入其所在ARENA党,500万入了自己的腰包。弗洛莱斯不承认,后在哥斯达黎加的银行查实证据。此外还有34万美元无法说明来历等。
2014年5月9日,国际刑警向190个成员国发出对他的红色通缉令,9月5日在律师陪同下,去圣萨尔瓦多的警方自首。其后就一直在警方监控之下。
2015年12月3日经过庭审后,预计2016年1月18日,萨尔瓦多第五法庭将对其宣判。有报道估计,至少是10年以上的徒刑。