许多人除了早上会喝咖啡之外，饭后习惯再来一杯，但专家提醒，饭后千万别马上喝咖啡，否则恐怕会造成缺铁性贫血；另外，低咖啡因的咖啡不见得比较健康，专家建议，除非必要，尽量不要喝低咖啡因的咖啡。
有研究指出，适量的喝咖啡对健康有益，不但可以防失智，还能减少胆结石和脂肪肝的发生，但另一方面也有增加贫血的风险。《早安健康》报导，台大营养学博士吴映蓉表示，饭后马上喝咖啡，容易阻碍铁质吸收，而造成缺铁性贫血，因此最好饭后1至2个小时再喝。
另外，有些孕妇为了避免喝到咖啡因，而选择低咖啡因的咖啡，但吴映蓉指出，在去除咖啡因时，必须要用有机溶剂抽除，所以低咖啡因的咖啡反而有喝进有机溶剂的风险，建议除非必要，尽量不要喝低咖啡因的咖啡. 由于咖啡豆里含有咖啡油醇化合物，会增加人体的胆固醇，尤其对女性的影响特别大，一般的咖啡如果直接用机器煮而没有使用滤纸过滤，容易含有咖啡油醇；吴映蓉建议，咖啡煮完用滤纸过滤，可以去除绝大部分的咖啡油醇，也可减少增加胆固醇的风险。
