2004年2月，日本共同社、《朝日新闻》、《日本时报》和主要电视台等日本主流媒体都以相当显著的方式报道了这么一条新闻：中国海洋调查船“向阳红09”号于2月11日傍晚进入钓鱼岛列岛久场岛以北约22千米的海域内，日本海上保安厅巡逻艇发现该船后随即“示警”，探测船则在晚间19时30分许离开。 令人注目的是，日本多家媒体在报道这条消息的时候，均将“向阳红09”号海洋调查船往“情报”、“监视船”上引，误导人们徒生许多联想。根据中国国家海洋局北海分局“蓝色卫士”官方网站介绍，“向阳红09”号隶属中国海监第一支队，而该支队又隶属于中国国家海洋局北海分局、中国海监北海总队，主要负责黄海、渤海海域行政管理、保护海洋环境、预防及减少海洋灾害等使命。中国海监第一支队拥有7艘国际、国内较高装备水平的海监公务船，拥有高级船员110人，“向阳红09”号是其中的一艘。“向阳红09”号是综合性海洋科学调查船，可进行海洋水文物理、海洋气象等科学调查研究工作。该船为钢质，双层连续甲板，柴油机推进，双桨，双舵，主要从事中远海及大洋的航行任务。它由上海沪东造船厂建造，于1978年5月24日下水。北海分局的这些情况非常清楚地说明了“向阳红09”号海洋调查船的性质，并且这些情况也很容易查清。再之，中国曾多次重申，钓鱼岛及其附属岛屿是中国的固有领土，“向阳红09”号完全是合法合理的正常活动。 2004年4月15日，台“国防部”副部长陈肇敏在“立法院”证实，14日清晨7时30分，台海军雷达发现大陆船舰在台东外海的公海上滞留，海军随即监控并于15日凌晨依据规定通报“海巡署”指派“伟星舰”前往了解处理。陈肇敏还称，大陆船只经常出现在台湾海峡，其任务不只是调查水文，还调查其它参数。台军方称“不明船舰”是隶属大陆国家海洋局的“向阳红”级海洋环境调查船。 2004年5月10日，日本共同社等主流媒体又报道了一条消息：日本政府高官5月9日透露，针对中国主张日本最南端的“冲之鸟”为“岩石”，且中国海洋调查船有权在“未经日方许可”的情况下对“冲之鸟”附近水域进行调查活动一事，日本政府决定通过“外长级”等层面向中方表示抗议。早在今年3月，日本《读卖新闻》就已经提及此事，声称中国海洋调查船近年来已11次“入侵日本经济海域”，在“日本专属经济区”内从事“违法活动”。 中国方面则认为，“冲之鸟”是岩不是岛，所以中方在附近进行海洋科考活动无需事前通报日本。
