武德九年即公元626年四月二十三（辛巳），唐高祖李渊下诏命，让有司部门淘汰和清理天下的僧尼和男女道士。
这期间，虽然群雄已平，但外族的入侵不断。四月二十五（癸未），突厥入寇西会州。五月初一（戊子），虔州胡人成郎等人杀了长史，叛归梁师都。都督刘旻追击并杀了他们。五月初五（壬辰），党项入寇廓州。五月十一（戊戌），突厥入寇秦州。五月十五（壬寅），越州人卢南造反，杀了刺史宁道明。五月十九（丙午），吐谷浑和党项入寇河州。同时，突厥入寇兰州。五月二十九（丙辰），朝廷派平道将军柴绍带兵出击胡人。
六月初一（丁巳），太白（金星）白天也出现在天空。
秦王李世民与太子李建成和齐王李元吉矛盾很深。他觉得洛阳地形优胜，是军事要地，一旦朝廷发生事变，自己可以在那里避祸，便打算去守卫洛阳。于是李世民任命行台工部尚书温大雅镇守洛阳，派秦王府车骑将军荥阳人张亮带领身边的王保等一千多人前往洛阳，暗中交结崤山以东的豪杰，好对付将来的事变。他拿出很多金银布帛，让他们尽情使用。李元吉诬告张亮图谋不轨，把他关进监狱，立案调查。张亮坚持住了，什么话都没说。廷尉没有证据，只好放了他，让他回洛阳。
李建成在夜里召李世民到他府上，在酒里下了鸩毒，想害死他。李世民心口剧痛，吐了好几升血。淮安王李神通扶他回到西宫。唐高祖临幸西宫，问候李世民的疾病，并敕令李建成道：“秦王一贯不能喝酒。从今以后，不许再夜里狂饮。”并趁机跟李世民说：“首先提出起兵的建议，接着又平定了全国，这些都是你的功劳。我本想立你为嗣，但你却坚决推辞。况且建成年长，作为嗣君也已很久了，所以我不忍心夺去他的太子位置。我看你们兄弟似乎互不相容。你们一块身处京邑，必然会有纠纷和竞争。我还是让你回你的行台，到洛阳去，当陕河以东的主人。你也可以树立天子的旌旗，就像汉梁孝王（汉文帝嫡次子刘武，因为抵抗西汉七王之乱而得到这殊荣）那样。”李世民哭着推辞，说自己不想远离父皇的膝下。唐高祖说：“天下都是一家。东、西两都，相离很近。我要想你了，随时都可以动身前去看望，所以你也不用悲伤。”李世民将要离开时，李建成和李元吉一道密谋道：“秦王如果到了洛阳，一旦有了土地和军队，就无法控制住他了。不如把他留在长安，那样他不过是个匹夫而已，容易对付多了。”于是秘密派出许多亲信大臣，给唐高祖呈上密封奏事，说：“秦王身边的人们听说要到洛阳去，无不欢喜雀跃。看他的样子，恐怕是不会再回来了。”又让唐高祖宠幸的近臣把其中的利害解释给他听。唐高祖因此改变了主意，这事又被搁置起来了。
李建成和李元吉在后宫日夜在唐高祖面前大讲李世民的坏话。唐高祖信了他们，便准备治李世民的罪。陈叔达谏止道：“秦王有大功于天下，陛下绝不能废黜他。而且他性情刚烈，如果遭到挫折和压抑，只怕他受不了这忧愤，或许会得什么料不到的疾病，那时陛下将后悔莫及！”唐高祖这才作罢。李元吉秘密请求他杀了秦王，唐高祖说：“他有平定天下的大功，罪行并不明显，能用什么理由杀他？”李元吉说：“秦王当初平定东都时，在那里观望形势，迟疑着不肯回来。他还散发金钱布帛，树立个人的恩望，而且违抗敕命。这不是谋反是什么！只该尽快杀了他，还担心什么没有理由！”唐高祖没有回答。
秦王府的僚属都非常害怕，不知道该怎么办才好。行台考功郎中房玄龄跟比部郎中长孙无忌说：“如今双方的矛盾已经无法调和，一旦大祸触发，哪里只是秦王府的僚属肝脑涂地的事，实在也是社稷的担忧。如果我们劝秦王进行周公当年的大事（指周公杀了管叔和蔡叔二弟），那样就可以保家安国。存亡的关键时机，千万不能失去。要干就得在今日！”长孙无忌说：“我长久以来也一直这么想，只是不敢开口罢了。今天你所说的，正合我的心意。我要进去跟秦王把这事说明白了。”于是进去谒见李世民。李世民把房玄龄招来密谋，房玄龄说：“大王功盖天地，自然应当承继大业。今日的忧患和危险，正是上天要赞助大王。还希望大王千万不要迟疑犹豫。”于是和府属杜如晦一道劝李世民先下手为强，杀了李建成和李元吉。
李建成和李元吉因为秦王府有很多骁将，便想引诱他们接受自己的驱使。他们秘密送了一车金银器玩给左二副护军尉迟敬德，并写信招诱他说：“希望得到长者的眷顾，和将军成为布衣之交。”尉迟敬德谢辞道：“我尉迟敬德是穷人家出身的人，遭遇隋末的大乱和离散，长久沦落在敌虏的地方，本来罪不容诛。是秦王赐给我再生的恩惠，今天又在他的藩邸任职。我对他只能以死相报。我对殿下毫无功勋可言，不敢胡乱地接受重赐。如果我私下和殿下交往，那是对秦王怀有贰心，等于是个见利忘义，舍弃忠诚的人。这样的人对殿下又有什么用处！”李建成很愤怒，便和他断绝了往来。尉迟敬德把这事告知李世民，李世民说：“尉迟公心如山岳一般崇高，即使成斗的黄金，我也知道你会矢志不移。他送的东西你只管接受，怕他什么！而且还能利用机会探听到他们的阴谋，这不是很好的计策吗？不然，大祸可能就会临到尉迟公的头上。”后来李元吉果然派壮士在夜里前来行刺尉迟敬德。尉迟敬德知道后，把双重门开得大大的，安静地躺着不动。刺客屡次进了他的庭院，但始终不敢进卧室。李元吉于是在唐高祖面前大讲尉迟敬德的坏话，唐高祖下诏将他逮捕入狱，准备杀了他。但由于李世民的再三请求，尉迟敬德才得免一死。李元吉又在唐高祖面前讲左一马军总管程知节的坏话，朝廷便将他外派去任康州刺史。程知节跟李世民说：“大王身边的股肱和羽翼都被他们支走，这样的情况不能继续下去了！我程知节死也不会离去，还希望大王尽早决计。”李元吉又用金银布帛去招诱右二护军段志玄，但段志玄也不听他的。李建成跟李元吉说：“秦王府的智谋之士，最可怕的莫过于房玄龄和杜如晦两人。”于是在唐高祖面前大讲他们的坏话，把他们都从秦王府赶跑了。
李世民的心腹中只有长孙无忌还在府中。他和舅舅雍州治中高士廉、右候车骑将军三水人侯君集以及尉迟敬德等人，日夜劝说李世民杀了李建成和李元吉，但李世民一直犹豫不决。他去征求灵州大都督李靖和行军总管李世勣的意见，李靖和李勣都说：“大王因为功劳极高而被猜疑，我们都愿意为大王出犬马之力。”（通鉴的用词是他二人都“辞”，意思不是很清楚。但从下文看出，并非推辞的意思。所以这里引用了《旧唐书》的说法）。李世民从此很看重他二人。
刚好遇上突厥的郁射设带领好几万骑兵进驻河南，侵入边塞，包围了乌城。李建成推荐李元吉取代李世民去督令诸军北征，唐高祖答应了，于是命令李元吉督领右武卫大将军李艺和天纪将军张瑾等人去救乌城。李元吉要求尉迟敬德、程知节、段志玄以及秦王府右三统军秦叔宝等人偕行，并精选秦王帐下精锐的将士加强李元吉的军队。率更丞王晊暗中告知李世民说：“太子跟齐王说：‘今天你得到秦王的骁将精兵，拥有数万部众。我将和秦王一道到昆明池为齐王饯行，暗中派壮士将他杖杀在幕下，然后上奏说他暴病身亡。主上应当会相信。我到时进宫游说，让主上将政事交给我。尉迟敬德他们到了你手里后，应该把他们都活埋了。那时谁敢不服！’”李世民将这话转告长孙无忌等人，长孙无忌他们便劝李世民先下手为强，干掉他们。李世民叹道：“骨肉相残，是古今人们最厌恶的事。我固然知道大祸就在朝夕，但还是想等到他们发作后，再以大义讨伐他们，难道这样不好吗？”尉迟敬德说：“就人情事故而言，谁不爱惜性命！今天大家都愿意以死奉戴大王，这是上天授予的良机。大祸随时一触即发，而大王却还晏然不感到忧虑。大王即使不看重自己的性命，难道也不在乎宗庙社稷吗？大王如不采用我的建议，我将再次落草为寇，不能留在大王的身边，束手就擒，等待斧钺！”长孙无忌说：“不听从尉迟敬德的话，我们今天就完蛋了。大王如果一定要放弃尉迟敬德他们，我也将跟随他们一道离去，不能再侍奉大王了！”李世民说：“我讲的话也不能全部不听。你们再想想其他办法吧。”尉迟敬德说：“大王如今处理大事过于迟疑，这不算明智。面临危难还犹豫不决，也不算勇敢。况且大王平时养在身边的勇士八百多人，在外头的现在都已经入宫。他们早已穿上盔甲，手执兵器，箭在弦上，不得不发了。大王怎能在这样的情形下还安坐在这里？”
李世民寻访了府里的僚佐。大家都说：“齐王凶狠暴戾，终究不肯事奉他的兄长。近来听说护军薛实曾跟齐王说：‘大王的大名，合并起来就成了唐字。大王最终将会主持唐室的祭祀，’齐王听了非常高兴地说：‘只要除掉了秦王，今后干掉东宫将易如反掌。’他和太子谋求作乱尚未成功，就已有了干掉太子的心思。他叛乱的心肠贪得无厌，什么事干不出来！如果让他俩得逞，恐怕天下不再是大唐所有。以大王的贤惠，拿下他二人不过是地上捡起根草罢了。大王怎能为了履行匹夫的气节，忘记了社稷的重要！”李世民依然犹豫不决。大家问道：“大王觉得虞舜是什么样的人？”李世民答道：“当然是圣人。”大家说：“假如虞舜在浚通井水时被害，不是成为井里的泥土了吗？如果他在修理仓库屋顶时被杀，不也化成仓上的灰尘了吗（舜的父亲和弟弟曾想在这两个地方害死他）？那样，他怎能给天下人带来普遍的恩泽，让他的律法流传后世！所以他忍受了小的杖责，遇到致命的大杖他就躲避了。这还不是因为他心里装着大事的缘故吗？”李世民让他们占卜决定。幕僚张公谨从外面进来，看到这情景，当即把龟壳摔在地上，说：“占卜是用来决定有疑难的事。今天的事毫无疑问，还占什么卜！如果卜卦不吉，难道我们就不动手了吗！”于是决定了大计。
李世民让长孙无忌暗中去招来房玄龄等人，但他们说：“主上的敕旨不让我们继续侍奉秦王。今天如果私下拜谒，一定会被处死。所以我们不敢接受殿下的教令！”李世民怒不可遏，跟尉迟敬德说：“房玄龄和杜如晦岂能背叛于我！”他取下自己的佩刀授给尉迟敬德，说：“你去看看。如果真的没有前来的意思，可以砍下他俩的脑袋再回来。”尉迟敬德去了，和长孙无忌一道跟房玄龄他们解释说：“秦王已经决定了大计，你们应该尽快去和他共同商量具体部署。但我们一行四人要避免嫌疑，不能一块上路。”于是让房玄龄和杜如晦穿上道士的衣服，和长孙无忌一道进了秦王府，尉迟敬德则从其它路上赶过来。
六月初三（己未），太白又出现在白天。傅奕秘密启奏：“太白见于秦分，秦王当有天下。”意思是太白出现在秦国的属地，秦王将继承大统。唐高祖将他的密奏转给李世民看。于是李世民秘密上奏说，李建成和李元吉想在后宫作乱，还说：“臣丝毫没有对不起兄弟的地方，而今天他们要杀臣，似乎要为王世充和窦建德报仇。臣今天如果就这样枉死，永远离别了君王亲人，魂归地下，实在耻于在阴间见到那些贼首！”唐高祖看了奏折后，感到非常惊愕，批复说：“明天我会详细了解情况。你应该尽早前来参见。”
次日即历史上有名的六月四日，李世民带领长孙无忌等人入宫，派人埋伏在玄武门边。张婕妤暗中知道了李世民奏折都讲了些什么，急忙快马跑去告知李建成。李建成召来李元吉密谋，李元吉说：“应该马士发动东宫府上的兵马，然后称病不去上朝，再观察局势的变化。”李建成说：“我的兵马都已经动员戒严了。现在应当和贤弟一道入宫参见，在那里弄清情况。”于是和李元吉一起入宫，直接前往玄武门。唐高祖那时已召见了裴寂、萧瑀、陈叔达等人，想让他们调查这事。
李建成和李元吉到了临湖殿时，感觉不对头，当即调转马头往东宫府邸奔跑。李世民跟在后头呼唤他们。李元吉张弓要射杀李世民，但三次都没拉满大弓。李世民拉弓射击李建成，一箭就把他射杀了。
李建成是唐高祖李渊的长子。大业末年，李渊到汾、晋一带征伐叛贼，李建成携带家属寄居在河东。李渊在太原起兵时，派人去秘密召他回来。李建成和弟弟李元吉走小路奔赴太原。李建成到了后，李渊非常高兴，当即任命他为左领军大都督，封陇西郡公。他带兵攻略西河郡，并跟从李渊平定了长安。义宁元年（617）冬，隋恭帝拜他为唐国世子，开府，并为他设置僚属。翌年，隋恭帝任命他为抚军大将军和东讨元帅，派他带兵十万出征洛阳。回来后，隋恭帝任命他为尚书令。武德元年（618），唐高祖立他为皇太子。武德二年，司竹群盗祝山海有部众一千，自称护乡公。唐高祖派李建成率领将军桑显和进击并平定了祝山海。当时凉州人安兴贵杀了凉州割据首领李轨，率众来降。唐高祖又派李建成到原州接应他们。当时气候炎热，而李建成又大肆围猎，士卒不堪劳苦，逃走的过半。唐高祖担心他不熟悉政务，总是让他学习时事，除非军国大务，其他政事都交给他处理，又派礼部尚书李纲和民部尚书郑善果担任东宫官属，和他商议政事。武德四年，稽胡酋帅刘仚成带领部落数万人成为边患，唐高祖又派李建成率师讨伐。他驻军在鄜州，和刘仚成军遭遇，结果击溃了他，斩首数百级，还俘虏了一千多人。李建成用计释放了他们的渠帅数十人，并授予官爵，让他们回去招抚群胡，因此刘仚成与部下大帅都请求归降。但李建成害怕胡人兵马依旧很多，担心出事，想把他们都杀了。于是他扬言说要增置州县，必须得有城邑，因此征召这些胡人，让他们带着修筑城墙的工具，到筑城的地方集中。他暗中调动部队，把他们都捉了。刘仚成听说事情不对，投奔了梁师都。李建成结果杀了投降的胡兵六千余人。当时李世民的功业日盛，唐高祖私下许诺立他为太子。李建成暗中得知后，便和齐王李元吉密谋作乱。当刘黑闼重新造反时，王珪和魏徵劝李建成要建功立业，好保住太子的位置。因此李建成请求出讨刘黑闼，并成功地生擒了他后凯旋而归。李建成后来的事前面都已细说，就不赘述了。李建成死时年三十八岁。他的长子太原王李承宗早死；次子安陆王李承道、河东王李承德、武安王李承训、汝南王李承明、钜鹿王李承义接着也都被杀了。
李建成被射死后，尉迟敬德带着七十名骑兵接着赶来。他身边的随骑把李元吉射下马去。李世民骑马跟着跑进树林里，结果被树枝挂住，跌下马来，一时爬不起来。李元吉跑了过来，夺下他的弓，眼看就要扼死了李世民。幸好尉迟敬德跃马赶来，把他叱喝住了。李元吉起身就要往武德殿逃跑，但被尉迟敬德追上，一箭射杀了。
李元吉是唐高祖李渊的第四子。李渊起兵后，任命他为太原郡守，封姑臧郡公，不久进封齐国公。唐高祖还任命为他负责十五郡军事的镇北大将军，留镇太原，允许他全权便宜行事。武德元年（618），他进爵为王，并授任并州总管。武德二年，刘武周南侵汾、晋，唐高祖派右卫将军宇文歆协助李元吉守卫并州。李元吉喜好畋猎，经常带着三十多辆载满捕捉鸟兽的网罟的车辆出去围猎。他曾说：“我宁可三日不食，不能一日不猎。”他又放纵身边随从，到处侵夺百姓。宇文歆频频劝谏，但李元吉不听。宇文歆只好上表把这是奏报给唐高祖，李元吉因此被免职。他又指使并州父老到宫阙请求，不久唐高祖就又恢复了他的职位。当时刘武周率领五千骑兵来到黄蛇岭，李元吉派车骑将军张达带领步卒一百人先去抵御。张达因为步卒太少，坚决不肯出行。李元吉硬派他去，结果一交战就全军覆没。张达非常愤怒，因此引来刘武周攻陷了榆次，接着进逼并州。李元吉大为恐惧，骗他的司马刘德威说：“你带着老弱守城，我率领强兵出战。”当夜出兵，其实是带着妻妾弃军逃回京师，因此并州失陷。唐高祖不久又加授李元吉为侍中、襄州道行台尚书令、稷州刺史。武德四年，李世民出征窦建德，将李元吉和屈突通留在东都城下继续包围王世充。王世充出兵拒战，李元吉设伏打败了他，斩首八百级，还生擒了他的大将乐仁昉和甲士千余人。王世充平定后，他因功官拜司空，并加赐衮冕的官服、前后部鼓吹乐二部、班剑二十人、黄金二千斤，并与李世民一块各得到三座鼓风炉，铸钱自给。武德六年，他加授隰州总管。李元吉很多事情前面都已细说，就不赘述了。李元吉死时年二十四岁。他有五个儿子：梁郡王李承业、渔阳王李承鸾、普安王李承奖、江夏王李承裕、义阳王李承度，全部被杀。
再说，翊卫车骑将军冯翊人冯立听说李建成死了，叹道：“岂有生时深受其恩，而死时却逃避其难的道理！”便和副护军薛万彻和屈直府左车骑万年人谢叔方率领东宫和齐王府的两千精兵直趋玄武门。张公谨力气很大，自己一人就把玄武门给关上了，东宫的兵马进不去。云麾将军敬君弘掌管宿卫兵，驻扎在玄武门，他挺身出战，但被亲友拦住，说：“事情怎么回事还不清楚。应该慢慢观察局势的变化，等到禁兵都来了后，再列阵出战，为时也不晚。”但敬君弘不肯，和中郎将吕世衡大喊大叫着出去冲杀，结果都死了。敬君弘是敬显隽的曾孙。守门的禁兵和薛万彻等人力战对抗了很久。薛万彻击鼓呐喊，想攻打秦王府，府上的将士大为恐惧。尉迟敬德提着李建成和李元吉的首级给他们看，东宫的府兵看到太子和齐王都死了，也就一哄而散。薛万彻只好带着几十个随骑逃进终南山。冯立杀了敬君弘后，跟他的徒众们说：“这也足以稍微回报了太子的恩典！”于是解散了队伍，自己逃到荒野去了。
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