受体的多态可塑及其荣辱。


受体的多态可塑及其荣辱。
直言简述,2020-12-05。
https://sites.google.com/site/zhiyanpage2/2020/z20201205-ace2

上个月底,美国疾控中心官员发文,主题是本次新冠病毒规模疫情的抗体检测,却提到了人类受体ACE2与抗体功能有关。本次疫情爆发,受体ACE2和病毒S-基因互动亲和力是关键。然而,此前,美国主管部门把全部注意力放到新冠病毒。这次终于提到受体,尽管只有寥寥数语,但毕竟提到了。


彼此密切相关的受体和病毒的多态性。

导致本次疫情的新冠病毒多变多态。下面是美国国家实验室发布的病毒S-基因D614G突变地理分布、以及《自然》杂志发表的受体ACE2表达频率地理分布:

受体ACE2表达频率由高到低的地理分布:
中国:0.9968;
远东:0.9935;
非洲:0.8235;
南亚:0.8022;
美洲:0.7538;
欧洲:0.6514。
来源:
Comparative genetic analysis of the novel coronavirus (2019-nCoV/SARS-CoV-2) receptor ACE2 in different populations,《Nature》,2020-02-24。

可看到病毒突变和受体频率两者呈现相当清晰的地缘反比对应关系:

新冠病毒D614G突变和受体ACE2表达频率的反比对应
  最弱或最低 中弱中强 最强或最高
病毒突变 中国 美洲 欧洲
受体频率 欧洲 美洲 中国


就病毒的D614G突变,在中国最弱,稍强是北美,最强是欧洲。
就受体频率表达的高低,在中国最强、次强是北美,最弱是欧洲。

这一目了然地说明了真相:

人类受体基因具有不同人群(包括民族分布和地理分布)的多态性。把这种多态性的事实称为【阴谋论】【白痴】【谣言】的做法本身就涉嫌是试图掩盖真相的【阴谋】。

在中国及其人群,受体频率表达最高和病毒突变最弱,反映了彼此亲和力和适应性都是最强的事实,说明了本次疫情的病毒病源就在中国大陆。所谓【本次疫情始发地不是病源地】或【境外输入】等说法,都是试图摆脱责任而搞【甩锅】的欺骗。

在欧洲及其人群,受体频率表达最低和病毒突变最强,说明彼此亲和力和适应性都是最弱的;本次疫情及其病毒的病源不在欧洲。

北美居中,不是本次疫情及其病毒的病源,但具有中国大陆和欧洲大陆两者的受体与病毒的多态特性,故而最有可能成为疫情规模最大之地。



疫情前的受体ACE2多态性研究。

尽管本次疫情爆发后,中国大陆主管部门官员编造故事否认受体基因多态性,说受体基因没性别之别和没有人群民族和地理分布之别,但疫情前的多年里,中国学界关于受体基因多态性的调研,不仅是中国大陆方面引以为【领先世界】的政绩、且颇为国际学界刮目相看。下面,是美国卫生部网站转发的中国学者调研论文关于大陆北方汉族女性受体基因多态性的部分基因序列数据:
 

Table S1: Primers used in the study (female)
SNP ID Fist-PCRP Second-PCRP UEP-SEQ
rs1514283 ACGTTGGATGTGCCC ACGTTGGATGTGCCTT CCCCTTCATCAACA
TTAAACACAGCAGTC GCAACCTAGATTAG GCTCCA
rs2285666 ACGTTGGATGCGTTTC ACGTTGGATGGCAAAG TTATGGTGCAATTAT
TGAGTAGAATATC GTTCAGCAATGCAC CTGAA
rs4646155 ACGTTGGATGCCAATA ACGTTGGATGCTTCTG CCTTCACCTTGGCA
TGACCCTGTAAACC GGCATGTTCTTAAC AAATAAACTT
rs4646176 ACGTTGGATGCTACC ACGTTGGATGCTCTGT GAGGAAGTGGTAGC
CGAGACTACTCTTTC CGTTAACACCTGTC TTTGATT
rs879922 ACGTTGGATGTTTGTC ACGTTGGATGGAGCTC TTCAAGGACTGGGG
TTCTTGTTACTGGC CAGCAAATTCAAGG TTA
*all primers were provided by BGI Life Tech Co., Ltd. (Beijing, China).
Source: Medicine 2018 Oct; 97(42): e12917/2018 Oct 19.
URL:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6211892/


调研论文发表于2018年10月19日,作者是中国大陆齐齐哈尔的医学界人士。论文说明,其基因数据来自中国大陆华大基因生命技术公司。该公司以中国国家基因库名义而闻名;之前,华大基因采集和研究了14万中国女性基因样本、并准备好了做300万中国女性基因样本的研究。那是当时中国大陆方面引以为世界规模最大的和自己【领先世界】的重要成果而大加宣扬,以至于有人提出质疑、就遭到【侵权】的华大基因诉讼和地方法院的判决。

上述五个样本是人体不同部位的受体基因。就其中【rs879922】,美国官方基因库记录说明:它的首次采集时间是2000年、更新和确证的发布时间是2013年;更新确证长度为3519BP,属于人类受体基因组中的【C/>G】类型的mRNA等位基因(组),其表达频率最高者是【C=0.463 】和【G=0.4918】、最低者是【C=0.07】甚至接近零,因人而异;它的功能,除了与冠状病毒S-基因组互动而可发生病毒直接传播于人类之外,还对肾功能和生育能力有影响。

之前,其它科研也说明受体ACE2具有人群民族和地理分布的多态性。譬如,云贵地方医学院于2013-09发表的调研论文指出,彝族男性的rs3729977等位基因C携带者以及女性AGTR2基因的rs5194位点的A等位基因携带者患高血压相对风险升高,汉族女性的rs2074192的和rs879922的基因型、在哈尼族女性的rs4646140的基因型以及男性的rs2106809和rs4646140的及rs2074192的等位基因人群,患高血压疾病的风险升高。这说明,受体ACE2并非所有人都一样,而是具有不同人群民族的差异、即ACE2多态性及其患病几率多样化。


附议:既然新冠病毒和受体的多态互动对生育能力有影响,那么,相关疫苗当然也如此。可是,利益关系集团和媒体一再打出【科普】【辟谣】的名义,把该影响称为【谣言】或【反科学】的【阴谋论】,其一个理由说没证据证明该影响存在。事实:疫苗还没普及、因应急而临床试验没相关内容(到目前,相关疫苗试验主要包括两个内容:一是抗疫防疫的有效性,二是是否感染或复阳再感染及其是否致死的副作用;因急需,其它内容暂时没法做),当然就没证据;没证据就不能做任何结论,凭啥就说没影响呢?那些【辟谣】的不就是造谣的吗?看看美国卫生部和行业转发文章咋说的:


一:Potential risks of SARS-CoV-2 infection on reproductive health。
Center for Reproductive Medicine, Peking University Third Hospital Beijing, China
Reprod Biomed Online. 2020 Apr 30.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7192111/ 

大意:中国北大第三医院论文说明,新冠病毒感染对生育有潜在危害风险。

二:How will the first COVID-19 vaccine affect women? 'This leaves a big question mark'。
by Alison Bowen, Chicago Tribune, JULY 22, 2020.
https://medicalxpress.com/news/2020-07-covid-vaccine-affect-women-big.html 

大意:美国一个专职女性健康的机构负责人说,尽管受体有明显的性别差异,但新冠疫苗试验却没有性别差异内容,这就给疫苗对女性健康的影响留下了巨大问号,是令人诅丧的。


本次疫情前的受体多态性技术发明的荣耀。

例子颇多,就说一个。本次疫情前,号称中国国家基因库的华大基因是以基因多态性技术为荣的,譬如:

一】黄种人基因组图谱面世。
2007年10月12日 08:50 南方都市报。
http://tech.sina.com.cn/d/2007-10-12/08501788558.shtml
注:所谓【黄种人】就是人群民族差异。就该差异研究,当时誉为【里程碑】政绩。

二】专利:CN101914628A。
检测基因组目标区域多态性位点的方法及系统。
2010-09-02 filed by 深圳华大基因科技有限公司。
https://patents.google.com/patent/CN101914628A/zh 
注:专利起码要求之一是现实存在。若人类基因都一样而不存在人群民族差异,那么,这专利不就是欺骗获得而应撤掉且华大基因应向客户做出道歉和赔偿了?

三】南方人免疫力更强?新研究首次揭秘中国人群基因遗传特征。
源:华大基因 发布时间:2018/10/11 10:33:04。
http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2018/10/418508.shtm 
注:该研究基于华大基因采集的中国大陆14万女性基因样本、目的是无创产前基因检测。尽管其南北方人群的免疫力的研究并非该样本采集的目的(涉嫌违反知情书等规范),但当局媒体还是把那个基因的多态性即人群差异的大规模研究作为中国方面【领先世界】的政绩做宣传。

类似例子挺多,都是中国当局把受体基因组(或其它基因组)的多态性及其人群民族差异特征的发现和技术发明作为自夸的荣耀而张扬宣传的。



本次疫情爆发后对受体多态性的否定。

本次疫情爆发初期,【科普中国】发文否定受体ACE2多态性,说:【美国南卡罗莱纳大学的一个研究小组发现,在种族(亚裔与白种人)、年龄(大于60岁与小于60岁)或性别(男性与女性)之间,ACE2基因的表达没有显著差异。……,由于ACE2基因的表达没有显著差异,也就说明SARS-CoV-2不会厚亚洲人而薄白种人,专门针对亚洲人进行攻击】,云云。

事实:那不是一个【研究小组】、而是一个个人研究,作者是
Guoshuai Cai,见:Tobacco-use disparity in gene expression of ACE2, the receptor of 2019-nCov,Guoshuai Cai,University of South Carolina,NOT PEER-REVIEWED | 5 Feb 2020,https://www.preprints.org/manuscript/202002.0051/v1

事实:该研究样品来自早已发表的学者论文提供的数据,譬如,其中之一是【
GSE40419】,美国官方记录:
Series GSE40419 , Public on Sep 06, 2012。
链接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE40419 
Title:The transcriptional landscape and mutational profile of lung adenocarcinoma
Overall design:RNA-Seq for 87 lung adenocarcinomas and 77 adjacent normal tissues #


那是韩国学者2012年论文所使用的朝鲜族肺癌患者和非患者的细胞数据及其吸烟与否的基因突变比对,目标是如何提高检测效率以便防病致病。该论文及数据的目标是肺癌检测,因而,没有受体基因组ACE2的分析比对内容及其讨论,而这才是该基因组人群民族差异如何的依据。就是说,【科普中国】搞了张冠李戴(若不说篡改)、搞的是骗人的伪科普。

疫情前,要摆政绩和要资金了,就把包括受体在内的人类基因多态性科研作为【领先世界】的政绩自夸张扬;发生疫情了,要追究责任了,就否定受体在内的人类基因多态性、且给多态性贴上【阴谋论】、【谣言】和【白痴】的标签而搞舆论轰炸式的攻击。----那种有权无责和出尔反尔而毫无信用可言的做法,以前也发生过:2008年四川大地震前,官员学媒自吹地震可以预测预报且中国是【世界领先】的;大地震造成巨大灾害和要追责了,他们又自打耳光地说,地震不可预测和不可预报、是【世界难题】、谁说地震可预测预报就是【谣言】和【反科学】。



受体ACE2的可塑性。

受体ACE2的多态性、尤其是它的同一人群中的个性化多态性,无疑,把该受体的可塑性摆上桌面。所谓可塑性,说的是用某种工程技术来人为地改变基因结构及其功能或功能效力。

自1997年首个用基因技术(敲除)改造受体ACE2的专利问世以来,相关业务早已遍地开花。其中,用基因技术做定点突变来改变受体基因组的表达频率即改变其与病毒的亲和力、最为流行。举例:

例一:专利【CN101961493A】。
Ace2激活用于治疗心脏、肺和肾脏疾病及高血压。
2003-06-19 filed by 大学保健网。
https://patents.google.com/patent/CN101961493A/zh 
注:那是1997年专利的更新版和中国注册版。要点:通过基因编辑的敲除手段,改变受体ACE2的基因并使相关突变产生预期的表达频率,从而达到治病防疫的目的。该专利提供了首个完整的人类受体ACE2基因序列,在一定程度上促成了全球人类基因测序项目的落实。

例二:针对本次疫情的受体基因重塑建议。
Engineered ACE2 receptor traps potently neutralize SARS-CoV-2。
PNAS November 10, 2020 117 (45) 28046-28055; October 22, 2020)。
https://www.pnas.org/content/117/45/28046
注:那是今年11月10日美国国家科学院转发的论文。大意:通过基因工程技术手段(尤其是基因编辑的蛋白技术手段)来定点改造受体ACE2而使之拒绝与病毒互动,如此可达到抗疫防疫的目的并可免除疫苗副作用。

如此重塑受体基因组的做法,可能可以治病且避免药品副作用,但有个更大更严重的副作用被忽略了:基因编辑工具及其蛋白的残留的脱靶和基因驱动,可能对受体基因乃至多种基因组造成人为突变而导致预想不到和无法补救的破坏作用,结果是可能暂时抑制了新冠病情,却难免病毒突变而复阳、且还可能发生更多更严重的多种病情。

在中国大陆,基因编辑作物以常规育种名义铺开上市多年了,即它的残留在中国大陆的食品中、动物体中和人体中已经多年了。如此,不奇怪,中国大陆人群的受体基因表达频率短期内迅速提高而成为世界上表达频率最高者,结果,新冠病毒疫情首发于中国大陆,并非偶然。

譬如,美国卫生部转发的论文说明,2005年,中国大陆人群的受体基因组表达频率,平均为41%左右,与近邻国家平均频率大体相同或近似。另一篇论文说明,到了2019年底和2020年初,该平均频率达到95%以上,大约15年时间里翻了一番。尽管不同论文的样品人不同,但中国大陆人群的受体基因表达频率显著提高的这个趋势是非常明显的。

重复说,导致本次全球超级规模的新冠病毒疫情,是三个因素的组合作用:受体(对象)、病毒(材料)和基因编辑(手段),缺一而难以发生本次规模疫情。因此,抗疫防疫,不能只看针对病毒的疫苗或其它药品,还要看受体基因如何以及相关基因技术管理,更要立即严限严禁包括基因编辑作物的基改农业。

附录:

受体多态性:意大利和全球的人群ACE2等位基因变体的比较。
SNV ITA AFR AMR EUR EAS SAS
rs35803318 C/T C:231 C:1002 C:629 C:430 C:764 C:718
T:13 T:1 T:44 T:26 T:0 T:0
rs2285666 C/T C:209 C:791 C:458 C:345 C:354 C:374
T:35 T:212 T:215 T:111 T:410 T:344
rs41303171 T/C T:242 T:1003 T:668 T:447 T:764 T:717
C:2 C:0 C:5 C:9 C:0 C:1
rs774469453 A/- A:242 A:1002 A:650 A:456 A:757 A:716
-:2 -:1 -:23 -:0 -:7 -:2
rs773676270 T/C T:243 T:1003 T:673 T:456 T:764 T:717
C:1 C:0 C:0 C:0 C:0 C:1
ITA:意大利;AFR:非洲;AMR:美洲;EUR:欧洲;EAS:东亚;SAS:东南亚。     
来源:Analysis of ACE2 Genetic Variability among Populations,2020-07-03     
链接: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7397291/

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