基因重组一般是指运用于微生物的生物工程技术，处理对象一般是细菌，病毒，简单的真菌，或者是培养液中的离体细胞，一般不包括对多细胞真核生物的处理（活体动植物）。基因重组引入的基因（1）通常难以通过自发变异或诱发变异来获得，因此往往来源于别的菌种或物种，经过人工修饰，或人工合成；（2）可以遗传，但不一定被引入在稳定而且是必须的主体遗传物质 —— DNA主链上，有可能被引入于质粒（plasmid）或人工合成的质粒上，当然也可以被引入于DNA 主链上；（3）可以改变重组过的菌种的基因调控，或可以表达产生新的蛋白质。
基因重组技术成功的用于量产多种药用抗体和药用蛋白，比如治疗乳腺癌的Herceptin，就是用基因重组的细胞培养方法生产提纯的。HBSAg （乙肝疫苗）是另外一个例子。
转基因是指将外源性（不同物种）基因引入于动植物活体的染色体内，可稳定遗传，并表现出新性状的生物技术。引入方式包括质粒，脂质体，病毒，原核注射，等等。
可以看出，基因重组和转基因在技术上并没有原则性的区别，主要的差别在于运作对象。基因重组的对象比较简单，一般是微生物或培养液中的细胞；转基因的对象是动植物活体，相对复杂。这两个技术的共性是引入的基因数目很少，属于外源性（不同物种），而且很“纯净”，一般不含有目标基因以外的其他“无用的杂质”基因。这是分子生物学技术的特点。有性生殖的动植物变异或进化很少具有这个特性。人工杂交培养的物种也没有这个特性。动植物的有性生殖决定了生殖细胞需要融合。单个生殖细胞的变异属于内源性变异。杂交或不同物种间的生殖细胞的融合（如驴和马）使得引入的外源性基因数量很多，很难把单个的目标基因与其它基因分别开来。
这两个貌似不同的术语反映出科学技术领域的一种倾向，即用新术语来描述稍有不同的概念或技术，以此标新立异。我们在日常生活中也常有这样的现象，比如用“淡定”来描述不为所动，情绪镇定，等等。或许是人类的喜新厌旧在语言上的一种表现。
在运用基因重组或转基因时，人类对目标基因的选择标准是很难把握的事情，尤其是当金钱利益处于选择标准的首要地位或重要地位时。我们人类是自私的，我们的知识是有限和片面的。贪婪加上自以为是的知识会带来更大的危害。另一方面，人口增长的压力越来越大，转基因确实可以增产增收。要不要转基因，左右为难。我认为现在对转基因植物的长期影响研究太少，很不慎重。即使目前在科学上挑不出毛病，也应长期实验观察，不应急着投放市场。只要我有钱，一定去买非转基因食物。
急功近利地使用科学技术，会造成危害。除了滴滴涕的例子外，另一个例子也很有意思。大约在60年代，美国厂商要求对粮食进行精加工，大量生产精白面，精白米，以便更好的适合人的口味。有人指出，这样的话，消费者损失了大量的维生素。为此在国会举行听证，辩论。一位议员说，精加工把上帝加在食物中的维生素去掉了，不要这样做。一位知名科学家说，我们往里面添加维生素就是了，就是在做上帝的工作。那位议员无言以对。几十年过去了，人们意识到精加工的食物不好。可是现在大量增加的各种富贵病与食品精加工有关，而且商店里全麦面粉和糙米的价格却比精加工的要贵。
