即便是方舟子对其科学哲学知识的卖弄也不是无懈可击的。请看：“科学界对判断什么是科学，是有公认的标准的，┄┄其中最主要的是逻辑的标准和经验的标准。这里说的经验，不是生活经验、历史经验，而是哲学说的经验，其实就是指观察、实验，因此也可以简单地把科学说成是逻辑加实证。” 对于广义的科学而言，逻辑自洽和经验检验是主要标准，只不过经验没有被局限在科学经验之内而已。对现代科学而言，逻辑自洽标准没变，但经验标准就变成了实验检验标准，即科学经验标准。现代科学的经验即是指科学的观察和科学的实验，科学的经验即是在可控条件下的观察和实验，科学经验与生活经验的本质区别在与观察与试验是自发条件下发生的还是在可控条件下发生的。作为广义科学认识的中医学，符合逻辑自洽和经验标准，其经验是在自发条件下发生的；作为现代科学的现代医学，遵循逻辑自洽和科学经验标准，其经验是在可控条件下发生的。问题是，在方舟子这如何科学经验却变成了哲学说的经验了？一般哲学所说的经验是包括生活经验，历史经验和科学经验的，只有科学哲学才趋向于把其经验理解为科学经验。方舟子把科学哲学的经验说成是一般哲学的经验，是在故意制造混乱。你看，他为了达到攻击中医的目的，不惜故意贬低自己的学格，但我看不出这样做对他实现其目的会有什么帮助。因为当他把生活经验从哲学经验中踢出去的时候，并非是生活经验被踢出了哲学，而是他的混乱的概念和思想被哲学踢了出去。如果他能把生活经验踢出哲学经验，那么，他把中医学踢出广义科学认识的阴谋就能得逞了，但是，这是可能的么？科学经验是现代科学的标准，而生活经验则是古代科的标准。如果方舟子说中医学没有现代科学性，我是接受的；但如果方舟子说中医学甚至也不属于古代科学的范畴，则应当明说，而不是用一个不“科学”来模糊视线。不科学，包含了不现代科学和不古代科学，一个学科，当且仅当它既不现代科学，又不古代科学时，才能说它不科学，否，则说它不科学不成立。
