垂拱三年即公元687年闰正月初二（丁卯），朝廷封皇子（唐睿宗李旦的儿子）李成美为恒王，李隆基为楚王，李隆范为卫王，李隆业为赵王。
二月初五（己亥），太后武则天因为干旱避免在正殿上朝，并减少御膳。二月二十二（丙辰），突厥的阿史那骨笃禄等人入寇昌平，武则天命令左鹰扬大将军黑齿常之率领各军讨伐他们。
三月初一（乙丑），纳言韦思谦请求离职，武则天让他以太中大夫的身份致仕（退休）。
夏四月，太后武则天命令左相苏良嗣留守西京。当时尚方监裴匪躬检校（代理）西京宫苑的事务。他想要将苑中种植的蔬菜水果拿到市面出卖获利。苏良嗣说：“从前公仪休在鲁国为相，为了避免与百姓争利，还拔去自家的葵菜和辞退自家的织布妇女。从未听说过万乘君主去卖蔬菜水果的事。”裴匪躬这才作罢。
四月初八（辛丑），武则天追尊他长子（追谥为孝敬皇帝）李弘的妃子裴氏为哀皇后，葬于恭陵。五月二十（癸丑），她因为持续干旱，亲自过审囚犯，并命令九品以上京官上疏言事。
四月二十九（壬戌），武则天任命裴居道为纳言。五月初三（丙寅），她任命夏官侍郎京兆人张光辅为凤阁侍郎和同平章事。
凤阁侍郎兼同凤阁鸾台三品刘祎之私下跟凤阁舍人永年人贾大隐说：“太后既然废黜了昏君，另立明主，何必再临朝称制！不如归政给皇上，好安天下人的心。”贾大隐居然秘密把这话奏报给武则天。武则天很不高兴，跟身边侍从们说：“是我推荐他的，竟反过来背叛于我！”有人又诬告刘祎之接受归诚州都督孙万荣的黄金贿赂，还和许敬宗的妾私通。武则天于是命令肃州刺史王本立对他立案审理。王本立向刘祎之宣示武则天的敕令，刘祎之说：“不经过凤阁鸾台，怎能称为敕令！”武则天勃然大怒，认为他这是抗拒朝廷制使。五月初七（庚午），她赐刘祎之在家自尽。刘祎之死时年五十七岁。
刘祎之是常州晋陵人。他祖父刘兴宗曾任南陈鄱阳王谘议参军；他父亲刘子翼善于吟咏讽诵，既有学问又有操行。隋大业初年，他出任秘书监；河东人柳顾言十分看重他。刘子翼性格耿直，目不容沙，朋僚有短处时，他总是当面折损。友人李伯药常说：“刘四虽然总是骂人，但人都不恨他。”贞观元年（627），朝廷下诏召刘子翼入京，但他因母亲年老坚决谢辞，唐太宗也就答应让他在家照顾母亲，为她送终。江南大使李袭誉嘉许他的至孝，总赠送他大米和布帛，并上表旌扬他的门闾，将他住的里弄改名为孝慈里。母亲去世后，他服完了整个丧期，然后才出任吴王府功曹，后来升迁为著作郎和弘文馆直学士，并参预修撰《晋书》，也因此加授朝散大夫。刘子翼死于永徽初年，唐高宗还派使者前往吊唁赠予，并派给他灵车送棺柩还乡。刘子翼留有文集二十卷。
刘祎之少年时就和孟利贞、高智周、郭正一以文藻知名，当时人们称他们为刘、孟、高、郭。他不久就与孟利贞等人一道在昭文馆当值。上元中年（675），他升迁左史兼弘文馆直学士，与著作郎元万顷，左史范履冰、苗楚客，右史周思茂、韩楚宾等人被召入禁中，共同撰写《列女传》、《臣轨》、《百僚新诫》、《乐书》，共千余卷。当时武则天又秘密命令他们参决政事，以分散宰相的大权。当时人们称他们为“北门学士”。刘祎之兄长刘懿之，当时任给事中，兄弟并居两省，成为一时美谈。
仪凤二年（677），他转任朝议大夫和中书侍郎，兼任豫王府司马，不久就加授中大夫。刘祎之有个姐姐在宫中担任内职，天后武则天让她去探省母亲荣国夫人的疾病，刘祎之暗中也趁机去见了荣国夫人，结果因此被发配到巂州。几年后，武则天上表请求唐高宗李治召他回朝任中书舍人。他后来转为相王府司马，又升迁检校（代理）中书侍郎。唐高宗跟他说：“相王（即后来的唐睿宗李旦，最初名李轮）是朕的爱子。因为爱卿出身忠孝门第，所以让爱卿成为他的师范，只是希望他就像蓬生麻中那样，不扶自直罢了。”刘祎之居家非常孝敬友爱，广为士族称道，每次得到俸禄，他总是散给自己的亲属，唐高宗为此很看重他。武则天临朝后，对他非常亲信。当豫王李旦即位时，刘祎之参预了谋划，并因此官拜中书侍郎兼同中书门下三品，赐爵临淮男。当时军国多事，所有的诏书敕令，都由刘祎之一人起草。他构思敏捷，诏敕总是立马写好。当武则天更改官名后，刘祎之成为凤阁侍郎和同凤阁鸾台三品。
当时有司门员外郎房先敏因罪被贬为卫州司马。他前往宰相府申诉。内史骞味道跟他说：“这是皇太后决定的。”刘祎之跟房先敏说：“受到案件牵连改任官职，照例应该由臣下奏请。”武则天听说后，觉得骞味道好事归功自己，过失则推给君主，便将他贬为青州刺史。而刘祎之则相反，把好事归于君主，过错兜给自己，因此加授他为太中大夫，赐给百段布帛、一匹小马。她还因此给侍臣们说：“为臣的大体，在于彰扬君主的仁德。君主的仁德一旦发扬，难道不也是臣下的美事吗？而且君主是元首，臣下是股肱，君臣理应情同休戚，义均一体。从未听说过将手足的疾病转移到腹背，而还能得到一体的康健。骞味道缺乏赤胆忠心，已被朕屏退了。刘祎之竭忠奉上，情理可嘉。”纳言王德真回答说：“当年戴至德每有好事，总要归功于君主。”武则天说：“先帝总是称赞戴至德能这么做。到他去世时，还专门下制褒美崇扬他的事迹。为臣之道，没什么比这更重要的了。他因此传名万代，这难道不美好吗！”
仪凤中年（678），吐蕃成为边患。唐高宗跟侍臣们说：“吐蕃小丑，屡犯边境。朕近来集中精力在安抚上头，没有马上派兵诛灭。而戎狄豺狼，不知道感恩。对他们置之不理，则疆场日益惊骇；想法对付他们，又没听说有什么良好计策。你们应当极力谈论多种策略的得失，各尽所怀。”当时刘景仙、郭正一、皇甫文亮、杨思征、薛元超各有所奏。刘祎之时任中书舍人，回答说："臣观察了自古以来的明王圣主，无不苦于夷狄的侵扰。吐蕃时不时扰乱边隅，行为如同禽兽。但即使得到他们的土地，也不能居住；其实被他们侵凌，也不足为耻。还希望陛下放下万乘的威严，减少百姓的兵役劳役。“唐高宗很嘉许他的话。
刘祎之下狱时，唐睿宗曾为他上疏申辩。刘祎之的亲友都以为这下武则天一定会原宥他，私下向他道贺。刘祎之说：“我这下更是必死无疑了。太后临朝独断，威福任由自己。皇帝上表，只能徒然加速我的灾祸罢了。“刘祎之关在狱里时，曾上疏自我申诉。临终时，他洗沐完毕，神色自若，还让儿子执笔起草谢恩表章。他儿子悲痛欲绝，几乎不能书写。监刑者再三催促，刘祎之于是亲自拿来几张纸，援笔立成，词理非常恳切至诚，读过这一表章的人无不悲伤痛心。当时麟台郎郭翰和太子文学周思钧都感叹他的文笔。武则天得知后非常厌恶，当即将郭翰贬为巫州司法，将周思钧贬为播州司仓。唐睿宗复位后，因为刘祎之是他东宫府的旧僚，追赠他为中书令。这是后话。刘祎之有文集七十卷，流传于当时。
秋七月初五（丁卯），冀州上言说有雌鸡化为雄鸡。七月十三（乙亥），京师地震，据说广州下金雨。
七月三十（壬辰，《旧唐书》作八月。也许根据不同历法壬辰为八月初一；《新唐书》则说是八月壬子），武则天让地官尚书魏玄同检校（代理）纳言。
岭南的俚户（土著居民）按照旧例只交一半课税，而交趾都护刘延祐却要他们交纳全部课税。俚户不肯，刘延祐于是杀了他们的魁首。魁首的党羽交趾人李思慎（也作李嗣仙）等人因此起兵作乱，攻破安南府城，杀了刘延祐。桂州司马曹玄静带兵讨伐并杀了李思慎等人。
突厥的阿史那骨笃禄和阿史德元珍入寇朔州，朝廷派燕然道大总管黑齿常之出击，并任命左鹰扬大将军李多祚作为他的副将。他们在黄花堆击溃突厥，追杀了四十余里。突厥人全都逃散跑到漠北去了。李多祚世代都是酋长，因军功得以入宫宿卫。黑齿常之每次得到赏赐，全都分给将士。他曾有一匹骏马，被一个军士不小心损伤了。黑齿常之的部属请求鞭笞那个军士，黑齿常之说：“岂能因为私人的马匹去鞭笞官府的士兵！”最终并不追问。
九月十八（己卯），虢州人杨初成冒称郎将，伪造朝廷制令，在都市招募人员，说要到房州去迎接庐陵王复位。结果事情败露，杨初成被官府处死。
冬十月初九（庚子），右监门卫中郎将爨宝璧与突厥的阿史那骨笃禄和阿史德元珍开战，结果全军覆没，爨宝璧只带着几个随从骑马逃回。爨宝璧见到黑齿常之立功，便上表请求带兵去穷追余寇。朝廷下诏让他和黑齿常之商议，遥相声援。但爨宝璧想要独占首功，就不等黑齿常之，自己率领精卒一万三千人先行，出塞二千多里，去袭击突厥部落。到了那里后，他又先派人告知突厥人，让他们得以森严戒备。因此两军交战后，爨宝璧惨败。武则天杀了爨宝璧，并将阿史那骨笃禄改名为阿史那不卒禄。
同时，武则天命令魏玄同留守西京。
武承嗣又指使人诬陷施州刺史李孝逸，说李孝逸在前往益州任职的路上，曾经自己解释他名字里的“逸”字，说：“走绕的兔子，常在月中。月亮既然靠近昊天，就该有天子的福分。”十一月十八（戊寅），武则天因为李孝逸有功，免了他的死罪，将他除名，流放到儋州。李孝逸最终死在那里。
李孝逸是唐高祖李渊堂弟李神通的小儿子。他少年时就好学，能写文章，最初封为梁郡公。唐高宗末年，他任给事中，经过四迁后升任益州大都督府长史。武则天临朝时，他入宫出任左卫将军，得到武则天的亲信。光宅元年（684），徐敬业占据扬州作乱。武则天任命李孝逸为左玉钤卫大将军兼扬州行军大总管，督军讨伐徐敬业。李孝逸率军平定徐敬业反叛的事前面都已细说，这里就不赘述了。李孝逸因功进授镇军大将军，后转为左豹韬卫大将军，改封吴国公。李孝逸历来很有名望，从那以后时誉更重，武承嗣等人非常嫉妒他，因此多次在武则天面前诋毁李孝逸。垂拱二年（686），他被贬为施州刺史。唐睿宗景云初年，朝廷追赠他为益州大都督。这是后话。
太后武则天想派韦待价带兵出击吐蕃。凤阁侍郎韦方质上奏，请求依照旧制派一名御史监军。武则天说：“古代的明君派将出征，总是将外面的战事全盘托付给大将。近来听说御史监军，军中事无大小，都必须通过御史承禀。这一以下制上，并非是很好的办法。况且这样做怎能责成他们有功！”因此取消了御史从军的计划。十二月初二（壬辰），武则天任命韦待价为安息道行军大总管，任命安西大都护阎温古为副手，出击吐蕃。
这年，全国饥荒严重，崤山以东和关内地区尤其严重。
要想知道武则天后来的情况，请看下篇文章。
