麻老大被打脸了
这里说的麻老大是麻省理工的大佬鲁道夫·贾尼施（Rudolf Jaenisch）教授，他的团队最近在美国科学院院志上发表了一篇文章，称新冠病毒的RNA可以在人体细胞里被反转录成DNA，然后整合或者崁入倒人的DNA或者基因库里。该文在没有正式发表前贴在网上时就引起一阵轰动，原因就是这个发现非常出人意外，打破了只有反转录病毒才能在人细胞里反转录的教条。
自那以后，就有很多争议，除了有很多人不信外，还有人说文中的发现不过是实验过程中引入的人为的东西。那么说的人都是从事这方面研究的小萝卜头，真正的大佬们公共场合譬如说被采访时说有趣，一带而过，不肯定也不否定。针对这种现象，我在前面的新冠反转录论文>一文里这么说：
”可是到底心里怎么想谁也不知道，估计真觉得有趣会马上让自己的研究生或者博士后连夜在实验室做实验看能不能重复了，假感兴趣的会心想让子弹飞一下吧，是真是假总会有水落石出的那一天，我们就不在这上面浪费时间和精力了。“
现在看来真的被我说中了，这不，没有过几天，就有两个不同的团队自己做了研究并发文说那东西是假的。第一篇已经被《病毒学杂志》（Journal of Virology)接收了。题目是：在SARS-CoV2感染的细胞中宿主病毒嵌合事件很少见并且是人为的 （Host-virus chimeric events in SARS-CoV2 infected cells are infrequent and artifactual）。
作者来自于普渡大学，密执安大学和美国国立卫生研究所（NIH)。他们说虽然有人报道RNASeq所得到的宿主-病毒嵌合RNA（HVC），并据此声称新冠病毒的基因物质可以整合或者崁入倒人的DNA或者基因库里，但是这种可能性却很小，因为该病毒是一种在细胞质中复制的正链RNA病毒，在其生命周期中根本就不需要也没有核相（进入细胞核）。因此，从生物学上讲它不可能出现在可能导致基因组整合的剪接事件的地方（细胞核）。
而那些宿主-病毒嵌合RNA是人为的，原因就是用现在普遍使用于检测RNA的方法RNAseq富集RNA时很容易得到实际上并不存在的人为宿主-病毒嵌合RNA。这种RNA片段的特征是多样化，随机发生，没有规律性，不像真正反转录形成的RNA片段那样比较均一且有规律。
当他们用另外一个方法而不是RNAseq在被感染的人细胞里去富集病毒RNA时，得到的都是病毒RNA而不是那些宿主-病毒嵌合RNA，据此他们说那些通过RNAseq得到的宿主-病毒嵌合RNA是因为该方法比较粗糙而造成的人为的东西。搞过RNAseq的人都知道这的确是这个方法的缺点之一。
https://jvi.asm.org/content/jvi/early/2021/05/07/JVI.00294-21.full.pdf
第二篇的题目是： 测序时所读SARS-CoV-2宿主嵌合RNA序列不一定表示病毒整合到宿主DNA中 （SARS-CoV-2-host chimeric RNA-sequencing reads do not necessarily signify virus integration into the host DNA ）。作者来自于英国伦敦的弗朗西斯·克里克研究所和帝国学院。他们自己做了转染细胞实验，发现在被线粒体DNA或游离型腺病毒DNA转染的细胞株中，最常见的SARS-CoV-2 RNA嵌合物是和从转染DNA转录的RNA之间形成的，这些东西不太可能是SARS-CoV-2整合到宿主细胞DNA的结果。
此外，SARS-CoV-2 RNA之间的嵌合片段多是和那些高度表达基因的外显子部分，而不是内含子或基因间的部分形成的，如果真正是整合的话，和这三部分形成的嵌合片段应该均等。这些发现表明RNA-seq得到的人类SARS-CoV-2嵌合读段很可能是在制作序列文库过程中出现的人工产物，而不一定代表有SARS-CoV-2反转录并整合到宿主DNA和进一步转录。
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.03.05.434119v1.full.pdf
做这两篇文出的是两个独立的研究团队，结论却高度一致，都显示用RNAseq这种方法在人样本中发现的人和病毒RNA的嵌合物不过在用该法富集RNA时的一些人为产物，根本就不是反转录形成的，换句话说麻老大的那些东西基本上是水货。
从这个事情来看，即使是麻省理工的大佬，也不一定那么严谨，不仅实验过程不严谨，得出的结论也不严谨，因为他们发现的虽然他们看到的都是RNA嵌入物，却一再强调是整合到DNA中的转录片段，那些东西不管是真是假都只是RNA而不是DNA崁合体。
麻老大这样做就像就像一个捉奸心切的私人侦探，在垃圾处理站一堆垃圾里看到了一名女人的内裤和万华茶室的伯伯们用过的套套放在一起，在没有捉奸在床的铁证情况下，就说她和伯伯乱搞，并拿到媒体去谋利，据说第一个大媒体（名杂志）拒收了他的东西，不知道是不是那家媒体让他去拿捉奸在床的照片不成没收，后来只得找熟人帮忙让PNAS收下了。
而这两研究团队的发现就像发现垃圾里名女人的内裤和伯伯们用过的套套放在一起只是一种人为的现象，并不代表她和伯伯们上过床，不仅还了那女人的一个清白，还查出了事情的真相。
我以前就觉得麻老大随便引申，说人家乱搞迟早会被打脸，只是没想到会来得这么快。
麻老大那篇文章出来后不少人不明真相，害怕新冠mRNA疫苗也有可能会被反转录嵌入人的基因库中，有人更拿其当虎皮，说mRNA的确可能那样，用以吓那些不懂的人。即使麻老大本人说不可能那样，并说他自己已经接种了mRNA疫苗，还是有人坚持那么说。麻老大如果还有良知和担当的话，就应该把那篇水货文章给扯了。
