诡异的蝙蝠RaTG13。
直言简评，2020-12-28.。
https://sites.google.com/site/zhiyanpage2/2020/z20201227-ratg13
推荐法广报道：
《新冠病毒溯源：严防外人靠近的云南通关蝙蝠洞引发关注》。
法广，安德烈，发表时间： 28/12/2020 - 00:59。
自本次疫情在中国武汉爆发以来，就我看到的中文版欧美主要媒体的报道评论，法广那篇报道最详实地阐明了国际学界关于蝙蝠RaTG13样本及其病毒基因数据来历不明的不同见解的来龙去脉。
中国武汉封城前三天、大陆主管部门官员公开承认疫情病毒可人传人之日，即2020年01月20日，中国武汉病毒所石正丽团队发出论文，指明导致疫情的新冠病毒的病源是他们在云南发现的蝙蝠RaTG13，主要根据是该蝙蝠携带病毒与武汉病号样本病毒的同源相似度为96%。
论文与当年二月初发表，遭到国际学界质疑：基因序列说明该样本采集时间是2013年07月24日，为啥六年半之后、恰好疫情规模爆发之后，才拿出来说道道？既然该蝙蝠是病源，那是否是武汉病毒所泄漏而导致疫情？
武汉病毒所一位负责人王延轶，先是给那些质疑扣个【阴谋论】帽子，然后回答说：【可能很多人都会有一个误解：既然武汉病毒所报道了RaTG-13和新冠病毒基因组的相似性，那么武汉病毒所就有这种病毒。但实际上不是这样的，我们只是在对蝙蝠样本进行测序的过程中知道了RaTG-13病毒的序列信息，但并没有去分离和获得过RaTG-13活病毒，所以也就不存在泄漏RaTG13的这样一个可能。】
那位负责人回避的问题是：为啥大体同期同地区的其它蝙蝠携带病毒与病号样本的相似度都是80%左右或低些，而偏偏是蝙蝠RaTG13的病毒就有96%的超高相似度？这个蝙蝠病毒S-基因同源检索的结果不是自然蝙蝠病毒、而是专利或人工嵌合体，咋回事？
夏季，本人推特有则匿名者给我的留言（并附带现场照片）说：他们用了一段时间，按照石正丽团队论文所说而重复石正丽团队作业，在石正丽他们采集蝙蝠RaTG13的地方、试图采集到携带同类相似度的蝙蝠样本，结果失败。不幸的是，我的推特账号被封闭，图片被删除，现在无法显示那则留言和照片。据BBC和法广报道，石正丽团队采集蝙蝠RaTG13的地方已被封闭、不许外人进入。
麻省理工一位CHAN某博士发文，通过基因比对和医学方法，对蝙蝠RaTG13病毒基因样本的可靠性提出质疑。结果，她遭到一些【主流媒体】操着武汉病毒所负责人腔调的猛烈抨击和个人攻击。请那些媒体及其作者拿出学术分析说明该基因比对错在何处而要搞舆论轰炸攻击，他们溜之乎也。
简言之，关于蝙蝠RaTG13及其病毒样本的来历，国际学界、主流媒体乃至相关主管部门采取的是政治化一言堂即只许说它是病源的做法，而对不同意见或质疑则采取封杀或扣个【阴谋论】帽子搞攻击.。
到今年11月，出现了一些值得关注的变化。譬如，美国国家科学院刊物发文，就病毒病源问题，提出要允许不同声音；有些媒体发表了质疑蝙蝠RaTG13的论文。
与此并行，提供该蝙蝠样本数据的中国武汉病毒所石正丽团队也有动作。譬如，11月24日，他们更新了一月20日发出的论文所提供的蝙蝠RaTG13的基因序列数据。使用美国卫生部数据库BLAST，将更新版与首版序列比对，结果：长度一样，相似度为99%，有个长度15个基因的片段变异。具体如下：
RaTG13: 20200324 x 20201124。
Query Length：29855。
Subject Length：29855。
Identities：29834/29870 (99%)。
Gaps：15/29870 (0%)。
| Query 1 CTTTCCAGGTAACAAACCAACGAACTCTCGATCTCTTGTAGATCT 45 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
| Sbjct 1 ATTAAAGGTTTATACCTTTCCAGGTAACAAACCAACGAACTCTCGATCTCTTGTAGATCT 60 |
| ：： |
| Query 29806 GTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 29855 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
| Sbjct 29821 GTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAA 29855 |
其中，20200324/Query为首版，20201124/Subject为更新版。
可以看到，更新版基因序列的起始多了15个BP【ATTAAAGGTTTATAC】、而尾部刚好就少了15个BP的【A】。这就有问题要问问武汉病毒所负责人王延轶了：
第一个问题：既然您说【我们只是在对蝙蝠样本进行测序的过程中知道了RaTG-13病毒的序列信息，但并没有去分离和获得过RaTG-13活病毒】，那么，该病毒新版的那个15BP的基因变异或突变是怎么发生的？就是把【序列信息】的符号ATGC做做文字版本的基因编辑吗？如此，首版序列就不是文字符号编辑而来的吗？
第二个问题：假设您单位拥有该蝙蝠携带的病毒的样本，那么，自然变异应该是随机散漫的（譬如在英国刚刚发生的变异），为啥那个更新版的突变是如此定位整齐、且首尾变异的长度都是一样的？若新版变异是实验室人工的，那么，首版序列就没人工合成成分吗？
第三个问题：该病毒变异或突变，不会凭白发生，而都是有个亲和力和适应性的关系问题，且一个BP基因变异就会有足够明显的功能改变现象。如此，您那个新版的长达15个BP的【ATTAAAGGTTTATAC】、是亲和力还是适应性的变异或突变？为啥不多不少刚好15个BP（翻译为蛋白是IKGLY）？。
到目前，包括中国大陆在内的全球学界和医学界乃至世卫组织，都把蝙蝠RaTG13作为导致本次超级规模的全球疫情的病毒病源看待。可是，该蝙蝠及其基因序列数据却充满了诡异成分，甚至稍微做做质疑都会被扣个【阴谋论】帽子而遭到学界媒体界的舆论轰炸或严酷封杀。这不是科学。这是为掩盖真相的政治化的阴谋：以【辟谣】的名义造谣，早已泛滥；如此，以【阴谋论】的名义搞阴谋，也不新鲜。不知本次疫情中丧生的百万在天之灵，是否看到了被称为害死他们的蝙蝠RaTG13是如此诡异多端？
附件：中国武汉病毒所石正丽团队提供的蝙蝠RaTG13携带的冠状病毒基因序列两个版本。
Bat coronavirus RaTG13, complete genome。
GenBank: MN996532.1。
29855 bp RNA linear VRL 24-MAR-2020。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MN996532.1
Bat coronavirus RaTG13, complete genome。
GenBank: MN996532.2。
29855 bp RNA linear VRL 24-NOV-2020。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide/MN996532.2
附件：武汉病毒所石正丽团队关于更新版论文的声明。
《自然》刊物发表于2020-11-17，发行于2020-12-03。该声明解释了该团队如何发现了蝙蝠RaTG13及其携带的冠状病毒，但没有关于蝙蝠RaTG13携带的病毒的基因序列更新的解释说明。
Addendum:
A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin。
Peng Zhou, Xing-Lou Yang, […]Zheng-Li Shi。 ..
Nature volume 588, pageE6(2020)。
The Original Article was published on 03 February 2020。
Published 17 November 2020/ Issue Date 03 December 2020。
链接：https://www.nature.com/articles/s41586-020-2951-z 。
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