孙可望自从把永历帝迁到安龙以后，朝廷大权已经完全被他掌握。所谓永历朝廷不过是个徒有虚名的空架子，仅仅靠着一小批扈从文武官员勉强支撑门面。军国大事都由孙可望在贵阳裁决，然后在形式上通知永历帝认可。如史籍所记：“时可望假天子名号令中外，调兵催饷，皆不上闻。生杀予夺，任意恣肆。帝在安龙，一不与闻。”南明管辖区内的相当一部分文官武将除了奉行永历年号外，心目中只有孙可望这位“国主”，皇帝被置之度外。此时孙可望已经放任甚至指使亲信部将拥戴自己登上皇帝宝座了。他身边的一批文职官员也巧加迎合，乘机大力劝进。如兵部尚书任僎借天命倡言“明运已终，事不可为矣”，主张永历帝禅位给孙可望；编修方于宣则为孙可望“定天子卤簿，定朝仪。言帝星明于井度，上书劝进”。当初朱由榔被迎接到安龙的时候，孙可望一度曾经打算去安龙陛见。任僎阻止他说：“国主欲进安龙，二龙岂便相见？”于是，孙可望连这个起码的礼节也取消了。
另一方面，连在安龙永历帝身边的权臣马吉翔也为自身富贵着相，暗中依附孙可望。他对太监庞天寿说：“今日大势，已归秦王，我辈须早与接纳，以为异日之地。”庞天寿一拍即合，深以为然，于是两人同孙可望派驻安龙的提塘官张应科等人结拜为兄弟，推心置腹地说：“秦王功德隆盛，天下钦仰。今日天命在秦，天之所命，人不能违。我辈意欲劝粤主禅位秦王，烦两公为我先达此意。”马吉翔还派人叫永历朝廷的郎中古其品画一张“尧舜禅让图”，准备送给孙可望。古其品忠于永历帝，拒绝作画。马吉翔怀恨在心，私下报告孙可望。孙可望竟然命令部下把古其品锁解贵阳，毙之杖下。当时在安龙永历朝中，马吉翔以文安侯掌戎政事，太监庞天寿提督勇卫营。永历朝廷在孙可望派遣的提塘官，安龙知府和心怀异志的朝内实权高官马吉翔，庞天寿的严密监视下，几乎没有自由空间，完全变成了傀儡。
据一些史籍记载，1654年（顺治十一年，永历八年）五，六月间孙可望曾经专程返回云南昆明，打算正式登基称帝。据说是由于选定的良辰吉日大雨如注，无法举行即位大典，实际上很可能是遇到了内部阻力（如与孙可望地位相当又掌握兵权的李定国，刘文秀坚决反对）才未能如愿以偿。孙可望图谋篡位还表现在他有时连朱明朝廷的正朔也有意弃之不用。例如，在湖南宝庆府紫阳河有一株很大的树，孙可望观赏后封之为“树王”，树干上刻“岁葵巳秦国主”。葵巳为1653年（永历七年）。次年八月在昆明举行了乡试，“父老相传此《题名录》刻秦甲午科字样”。孙可望在贵阳自设内阁，六部，科道等官，地方文官武将一概自行任命，官印由明朝的九叠篆文改为八叠。这些措施虽然有扫除南明朝廷用人惟贿，整肃官箴的积极意义，但实质上是帝制自为。有史料记载，孙可望在方于宣等人参与策划下，“定仪制，立太庙，庙享三主：太祖高皇帝主于中，张献忠主于左，而右则可望祖父主也。拟改国号曰后明，日夜谋禅受”。孙可望取代朱由榔的图谋在紧锣密鼓中进行着。（待续）
