过去一两百年里科学与宗教的关系是很多人关心的问题，也是很多争论的中心议题。其实，在科学与宗教之间还存在着一个过渡带，那就是超自然。过去的一两百年里人们之所以跨越了这个过渡带而直接使科学与宗教进行了交锋，是因为在以西方世界为主的大多数具有宗教信仰的国度里，宗教界是超自然力量的主要代言人，而科学又是在基督教的世界里脱颖而出的。因此，一旦涉及到超自然的问题，人们很容易就在宗教和科学这两个阵营中进行站队，而站队的结果便是双方跨过不具宗教背景的超自然的意义来直接进行交锋。这里的一个重要原因是宗教都具有排它性，因此任何一个宗教都不主张离开了自己的教义去谈超自然，而传统的科学又具有强烈的反超自然的倾向，所以当科学与宗教发生交锋时，不具宗教色彩的超自然这个过渡带也就自然而然地被跨了过去。
其实，科学与宗教跨过超自然而直接进行交锋是导致双方在辩论中很难说服对方的一个原因。我们知道宗教是高于一般的超自然现象的。是否存在超自然本身是一个零一答案的问题，而宗教本身则具有对于超自然的力量是如何作用在这个世界上并如何要求我们有相应的反应的一整套复杂的内容。由于至今为止对于很多宗教教义存在着解释上的不明确性和不一致性，使得人们在进行争论的时候往往是着眼于对教义的具体解释上（比如有关上帝造亚当的教义与生物进化之间的表面不一致性等），站在科学阵营里的人强调现有的宗教解释不符合科学的发现，而站在宗教阵营里的人则由于缺少必要的神学理论上的突破（我本人相信上帝一直在期待着基督徒们在神学理论上取得突破）而坚持已有的教义而不肯让步，所以双方相持不下。在这过程中，双方都忽略了一点，那就是科学的反宗教的根基其实并不是在于对具体的宗教教义的否定，而是在于对超自然存在的否定，一旦人们能够有力地表明超自然的存在，科学的反宗教的根基就被彻底动摇，科学的反宗教的防线也因而被彻底冲垮，那个时候人们再来讨论具体的宗教和对具体的教义的解释的时候就是一个神学理论的问题，而不是宗教与科学的冲突的问题了。
1986年我在中国科技大学读研究生的时候，曾经是了中国安徽省人体科学学生组的组长。当时我们几个学生（主要是生物系与物理系的本科生，只有我一个是研究生）发现了大量的超自然的现象。但是，我们当初就和现在的很多对科学缺乏了解的人一样，抱着“没有科学解释不了的，只有科学还没有解释的”信念，不承认那些现象是超自然的现象，认为那些只是科学一时还没有解释的自然现象而已，而我们的兴趣也正是要找到认识这些现象的科学方法。但是，真正的科学家在那个时候就认识到那些现象其实是超自然的现象。我们当时听说我们的副校长方励之承认那些人体特异的现象是真实的，这对我们来说是一种很大的鼓励，于是我们几个人就去找方励之， 想从他那里得到一些经费。但是，他当时的答复让我至今仍然记忆犹新。他说，第一他承认那些现象是真实的；第二，他不会给我们钱，因为科技大学是搞科学的，而那些现象是属于灵学的范畴，不属于科学研究的对象。当时我们几个人没有一个听懂了他说的是什么。直到12年以后我成为了基督徒才慢慢地理解了方励之教授当初所说的这番话的意义。。。。。。
