哈利13岁时，从姨妈家的电视， 从“夜骑士”Knight Bus 车上的报纸， 看到到处通缉越狱犯布莱克 Black。接着哈利从魔法购物村，到火车， 到学校， 得知越狱犯从前竟是哈利爸爸的同学和密友和自己的干爹，后出卖朋友，与伏地魔 Voldemort 结帮，杀死哈利父母，又夺走十三人生命，现在越狱追寻哈利。魔法部特意从阿兹卡班监狱派来摄魂怪 Dementors 跟踪保护哈利，以袭击越狱犯布莱克。可哈利每次遇到摄魂怪出现， 他就天旋地转，如病魔缠身，因为摄魂怪是专门靠吸取人类幸福意念而生存。 哈利从防卫教授卢品学到召唤“守护神” Patronus，对付摄魂怪。
一天罗恩被狗拖入树洞，哈利与赫敏营救，不料他们落入圈套见到越狱犯布莱克，这时才知道，罗恩的宠物老鼠是矮彼得，从前也是哈利爸爸同学，其实是他投靠伏地魔，背叛并使哈利父母遇难，而他栽赃布莱克，断指逃之，隐身为老鼠。12 年过去， 伏地魔元气恢复， 布莱克断定矮彼得重新投靠伏地魔杀害哈利。 哈利阻止布莱克除掉老鼠矮彼得。后矮彼得再次变鼠逃走。
哈利，布莱克走出树洞遭到摄魂怪袭击, 哈利挥神棒呼出守护神, 驱走摄魂怪，醒来已在医院，校方已软禁布莱克并即将执行摄魂怪死吻处刑。
哈利要救无辜的布莱克！凭着逆时表，哈利与赫敏使时间逆反，重新获得机会，首先救出将被断头的鹰翅马， 随后驾驭鹰翅马来到学校禁闭室救出布莱克，囚犯布莱克骑着鹰翅马飞驰远方。
哈利使两个无辜的生命逃出死亡魔爪 —— 阿兹卡班囚犯布莱克， 鹰翅马。
