新冠反转录论文

冬雪倘雅淡,不走也不嫌,春風若溫暖,遲到也喜歡。
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新冠反转录论文

去年就在网上流传的一篇来自MIT的关于新冠病毒可以反转录的论文终于在美国科学院院报(PNAS)上发表了,这篇论文从在网上一贴出到现在一直都很被关注和争议,主要原因文章打破了反转录必须在病毒反转录酶参与下进行的的教条,发现新冠可以在人细胞里可借人的反转录酶反转录并嵌入人的DNA中。

https://www.pnas.org/content/pnas/118/21/e2105968118.full.pdf

这些人做这个研究的原因是因为临床上发现一些新冠病患者在康复后很久又转阳了,虽然当时已经有人说是重新感染,但这些人却相信病毒的RNA可以反转录并嵌入到人体的DNA中,并因此长期存在。于是,他们就提出了这个大胆假设,然后到实验室里去小心求证。

为了求证,他们在体外用新冠病毒感染人肿瘤细胞株,这些细胞和人体本身被病毒感染的细胞不同,尽管如此,这个也没有什么,不少人用细胞株在体外做新冠病毒感染实验,问题是新冠病毒在感染这些细胞后并没有发生反转录,因为它们不属于反转录病毒,没有反转录的酶和其它反转录机制,怎么办呢?

没有不要紧,有现在科技,只要想做,没有多少做不了的事情。于是这些人就来了一高招,病毒没有,他们给人为地加进去,让这些细胞不仅被新冠病毒感染,还让它们人为地表达了一种人类的反转录酶。功夫不负有心人,他们成功了,并向世人宣布新冠病毒可以反转录了。

消息一出,果然在反转录研究领域引起了一阵不小的冲击,本来是一个小小的领域,平时也没有多少人注意,突然那么一来,大家都关注起来了。于是不少专家被请去做评论,多数人都说很有趣或者很有意义,却不再多发评论。

估计这些人除了这些外也没有什么多说的,肯定不是,否定也不是,就那么一家平时根本不做反转录新手研究出来的东西,没有人知道是否能够重复得了,让专家怎么肯定呢?可虽然不是专家,可人家毕竟是MIT的,不像那些野鸡大学的人,随便编编数据来哄人,搞篇文章提升用,人家已经是堂堂的MIT的PI了,没有必要那么做,让专家否定也不是。所以当被媒体问到怎么办呢?只能那么客套地泛泛而言,说有趣。

可是到底心里怎么想谁也不知道,估计真觉得有趣会马上让自己的研究生或者博士后连夜在实验室做实验看能不能重复了,假感兴趣的会心想让子弹飞一下吧,是真是假总会有水落石出的那一天,我们就不在这上面浪费时间和精力了。

也有不信邪敢怼MIT大牛的,有专门做这方面研究的一位博士后就说这些人根本就不知道自己在讲什么,所谓的反转录和嵌入人体DNA不过是在做实验的时候,把人和病毒的核酸给搅到一块去了,得出了让自己都信以为真的结果。

这么说的人虽然只是一个博士后,但可别小看这些人,他们往往是在某个研究领域里处在技术最前沿的,看东西比他们的PI还要厉害,更有他们是初生牛犊不怕虎,遇到自己怀疑的东西,不会像他们的导师那样客客气气地,说声有趣一带而过,他们会实话实说,没有什么可怕的,大不了将来找工作时不去MIT或不找MIT的那些人出references。

当然,到底是真还是假的下结论都为时过早,两者都有可能,在被人重复之前,没有人知道到底是真还是假。不管是真是假,这些人在讲到他们的这一发现的意义时,都很谨慎,既没有说会致癌,也没有说会发生在mRNA疫苗上。

人类DNA里面含的那些病毒或细菌的DNA,多数是长眠的,根本不会致癌。至于疫苗,人家莫当纳早就声明了,mRNA不会进入细胞核,即使进入了,可以和人的反转录酶接触,那mRNA上面也没有反转录酶作用的信号或者系列,就是说即使进去了也不会反转录。

说得再清楚不过了,如果还不信,硬拿人家MIT人的文章做虎皮当大旗去吓唬老百姓,不是根本不懂,就是别有用心了。

Moderna FDA Presentation Slide 

https://www.fda.gov/media/144583/download

三丝 发表评论于
N多年前,也曾经做过逆转录病毒的工作。也体会到找内源性的逆转录酶的痛苦。假如,假如,这一发现能被其它实验室证明的话,这将是个重大突破。但这篇文章的实验证据还很weak,也只有PNAS能这么发。照此推理,RNA 病毒,比入流感,同样也会插入基因组。会有实验室来验证的。试目以待。也许是个重大突破 (0。01%的可能性),也许根本就是人力物力的白费。
Fanreninus 发表评论于
回复 'shakuras2000' 的评论 : 是的,应该取消院士内定制度。
shakuras2000 发表评论于
回复 'Fanreninus' 的评论 : PNAS是美国科学院的期刊,以文章质量两极分化闻名。原因是PNAS除了普通作者提交稿件以外,还允许每个院士每年可以推荐一篇文章发表。所以经常看到低质量的文章发表,或者某早退休的院士实验室的博士后每年一篇PNAS灌水。当年谈家桢在国内的时候,某些人每年都带着手稿“拜访”谈老
Fanreninus 发表评论于
回复 'shakuras2000' 的评论 : 好像不是peer review而是指定某院士评审的。我也见过不少赶时髦,东一榔头西一榔头的大牛们,这个人可能也是如此, 你关于测序那个建议很好,不知是没能做出还是没有做,总之我不觉得这篇文章有什么意义,最多只是provocative,也许就是他所要的效果。
shakuras2000 发表评论于
关于楼下说“Fanreninus2021-05-10 17:19:01回复悄悄话回复 '赌城看客' 的评论 : 很想看有没有人能够重复这些实验。”。
重复实验不是问题,关键是他们的实验证明不了所谓的结论,有逻辑漏洞。话说这些逻辑漏洞Jaenisch这种大牛不知道?只要做一个基因组测序就能弥补漏洞把这篇20分的文章变成90分,人家就是不做,所以动动脚趾头就知道美国网红大牛的本色了
shakuras2000 发表评论于
这篇文章去年刚贴上bioarixv上就看到了,里面的“证据”漏洞太多,一出来就被一众科学家批判,也就PNAS这种专发垃圾的杂志敢收。

这篇文章的最后作者也就是大老板是干细胞届的超级大牛,副诺贝尔(副诺贝尔的意思是做了一堆千年老二的工作,所以诺贝尔是轮不到了)。这人本领域的人都知道有个特点,就是喜欢随便放大炮,所以大牛出垃圾文章我也不觉得稀奇
cowwoman 发表评论于
回复 'Fanreninus' 的评论 : 这个Covid19致死的病人,不光是因为免疫过度而死,死者里白细胞都减少了。白细胞减少也是判断Covid19病入膏肓的一个检测指标呢。艾滋病毒是球型,COVID19是球形加刺突。艾滋病破坏免疫系统机理算是清楚了,这个COVID19
也能抑制免疫系统。这些人估计找不到真相之前,就只能乱实验一通。最直接的猜想就是往HIV上靠。

Fanreninus 发表评论于
回复 'cowwoman' 的评论 : Good for you! 说有HIV片段早就被证实是不实之词了,也不排除没题找题,蹭热度。
cowwoman 发表评论于
我在学习病毒知识ing。看到HIV是逆转录病毒。Covid19
有的基因片段不是和艾滋病毒像吗?或许这些研究人员就是想极力证明猜想。

Fanreninus 发表评论于
回复 '赌城看客' 的评论 : 很想看有没有人能够重复这些实验。
赌城看客 发表评论于
去年12月12日发的预印本文章10.1101/2020.12.12.422516就曾引起争议。这次在PNAS刊载。两次的作者只保留了四位。佩服他们敢想、敢发的精神。
中国内地经常出现“复阳”的病例,相信他们在做类似的研究。
Fanreninus 发表评论于
路透社今天对那篇新冠反转录论文的报道及对研究团队头头的采访:

病毒可能会将基因片段插入患者的遗传密码中

一篇基于实验室实验的有争议的新论文对一些COVID-19幸存者为何在几个月后仍能在病毒RNA检测中呈阳性提出了一个可能的解释。来自冠状病毒的遗传指令的小片段可能会整合到受感染细胞的基因组中。

在实验中,插入细胞遗传密码的片段主要来自病毒基因组的尾端,它不能诱导细胞产生感染性病毒。但是,它们可能足以在COVID-19 PCR测试中触发阳性结果。

麻省理工学院怀特黑德生物医学研究所的负责该研究的负责人鲁道夫·贾尼施(Jaenisch)说:“没有证据表明这些整合进基因组的过程会造成危害。”他接着说研究人员认为这种可能性很小。

其他专家表示,于周四发表在《 PNAS》杂志上的这项发现可能反映了由实验方法造成的意想不到的效果。到目前为止,研究人员仅在试管中看到了这种现象。

他们试图寻找直接证据证明将SARS-CoV-2序列整合到患者的基因组中,“但是这些实验在技术上非常具有挑战性,” Jaenisch说。

辉瑞/ BioNTech BNTX.O>和Moderna的疫苗使用信使RNA来指导细胞产生类似于病毒位点的蛋白质。但是细胞会迅速分解RNA并消除它。 Jaenisch说:“没有证据表明疫苗RNA可以整合,我们认为这不太可能。”

他说,COVID-19引起并发症的高风险“将很强烈地促使人们接种该疫苗”,并指出注射疫苗的风险可忽略不计。



Virus might insert genetic fragments into patients' genetic code

A controversial new paper based on laboratory experiments suggests a possible explanation for why some COVID-19 survivors still test positive on viral RNA tests months later. Small fragments of genetic instructions from the coronavirus might get integrated into infected cells' genome. In the experiments, the fragments that got inserted into the cell's genetic code came mainly from the tail-end of the viral genome and cannot induce the cell to create infectious virus. However, they might be enough to trigger a positive result on COVID-19 PCR tests. "There is no evidence that the process of these integrations into the genome causes harm," said study leader Rudolf Jaenisch of the Whitehead Institute for Biomedical Research at MIT, adding that the researchers believe that is very unlikely. Other experts have said the findings, reported on Thursday in the journal PNAS, likely reflect unintended effects of experimental methods. The researchers have so far seen the phenomenon only in test tubes. They are trying to find direct evidence for SARS-CoV-2 sequences integrated into the genome in patients, "but these experiments are technically very challenging," Jaenisch said. The vaccines from Pfizer/BioNTech BNTX.O> and Moderna use messenger RNA to teach cells to make a protein that resembles a site on the virus. But the cell quickly breaks down the RNA and gets rid of it. "There is no evidence that vaccine RNA could integrate and we believe that this is highly unlikely," Jaenisch said. The high risks of complications from COVID-19 "would be a very strong incentive to get the vaccine," he said, citing negligible risk from the shots. (https://bit.ly/3tDs9P8)
Fanreninus 发表评论于
回复 'cowwoman' 的评论 : 没有必要, 是否相信和曲解科学,一目了然。
cowwoman 发表评论于
你可以和'小溪之水'博主辩论了。:)
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