万物本空, 皆由智慧觉心而现.
马克斯·普朗克 《物质的自然》 1944年于翡冷翠的讲演
在物理学看来，物质和运动似乎是自然世界的全部，然而，在经典物理学中，一个超越一切的观察者隐藏在一切物理规律的背后；在现代物理学尤其是相对论和量子力学中，观察者凸显在一切物理规律之中。在这种从外部研究自然世界的方法中，观察者可以定义为意识。传统的形而上学从内部开始探讨自然世界，从“我”即那个意识到自我存在的意识开始：我和非我是自然世界的全部，“我”即意识，非我即物质，在我和非我之外，存在着形形色色的关系，抽象称之为运动/能量。所以，不论是从客观出发，还是从主观出发，物质，运动/能量和意识都是探讨自然世界的三要素。
意识不仅仅局限于人，它独立蕴含在一切物质之中。从矿物到植物，到动物，到人就是生命意识之树的进化历程。物质，能量和意识三位一体，密不可分，称其最小的单位为原子。我们通常意义上的原子，比如氢原子，并不是最小的不可分割的单位，对其不断分割至夸克之下的前子(preon)，称之为1-原子。1-原子还可以接着分割。每个1-原子由49个2-原子构成，每个2-原子由49个3-原子构成，每个3-原子由49个4-原子构成。。。每个48-原子由49个49-原子构成。49-原子才是真正的不可分割的原子。
49种原子对应49个位面/维度/密度/空间/天。49个基本位面划分为7大位面，每个大位面下有7个基本位面，由低到高分别称为：物质位面（第1位面：第1亚位面1：1 到 第1位面：第7亚位面1：7），情感位面（2：1到2：7），思想位面（3：1 到3：7），混元位面（4：1 到4：7），灵性位面（5：1 到5：7），神性位面（6：1 到6：7），元位面（7：1 到7：7）。物质位面和情感位面对应欲界六重天，思想位面3：1到3：4对应色界二十二重天，思想位面3：5到3：7对应无色界四重天。我们存在的这49个基本位面又构成了更高宇宙的前7个基本位面。位面越高，物质越精微。由低位面的重厚物质组成的感觉器官是无法觉知更高位面的精微物质，就像鱼网可以捉鱼，但是无法捉空气一样。
物质，能量和意识在7大位面的表现不一。物质位面：物>识>能，情感位面：识>物>能，思想位面：物>能>识，混元位面：识>能>物，灵性位面：能>物>识，神性位面：能>识>物，元位面：物=识=能。7来源于3的组合，49合大衍之数五十，其用四十有九。
1-原子由10根互不接触的闭弦（3根明亮厚重的主弦和7根辅弦），以顺时针或逆时针旋转构成如图两种心型结构。正所谓“一生二二”：1-原子有正负，此为二；每种1-原子看似又为二。3个1-原子构成一个夸克。3体具有不可计算预测的混沌特性，现代物理学称之为夸克禁闭。9个1-原子按3分组，构成一个重子，正所谓“生三三”。重子（质子，中子等）是物质位面的起始，正所谓“生万物” 。
如图，每根弦有更精微的结构。
1-原子以9为基本单位组成了可见的物质世界。
1-原子在主物质位面还有别的组合，构成了不可见的暗物质世界/灵气。比如元气子和真气子都是由7个1-原子构成，只是构型不同。元气子中6个1－原子构成正六边形，第7个1－原子居中沿着正六边形的中垂线高速振动。真气子中7个1－原子构成环形，看似稳定，但是与3个1－原子或者5个1－原子结合后会释放大量的能量。在人体内，元气子以脾脏为源向别的器官分配，真气子以丹田为源向别的穴位分配。
CW Leadbeater说，整个宇宙充斥着一种非常厚重均匀的流体，他称之为koilon，本贴称之为鸿蒙海,类似现代物理学上的狄拉克海/希格斯场。49-原子就是这种物质中的空泡，类似现代物理学上量子泡沫, 但比量子泡沫的尺度小得多。49-原子在这种物质中的运动时受阻，表现为质量。此外，鸿蒙海的性状和玻爱凝聚很相似。
49-原子作为真正的不可分割的原子，是宇宙中所有粒子的根本。作为最精微的存在，它可以被认为是极小的纯粹能量单位。它循环于另外的48个位面，通过振动，转动或旋转给这些位面补充能量。这个无限的能源充斥着宇宙，称之为零点能。太一不断的创生49-原子，这可以从宇宙的不断膨胀中看出。
原子在多维振动，但是越是厚重的原子会越受限于它不断增长的物质面目和不断减少的能量面目。于是，物质位面（位面-1）的1-原子的运动限于3维，而元位面的49-原子可以在52个维度上振动。
以上模型由Leadbeater & Besant于1895年发表, 一个类似的粗略模型由Edwin Babbitt于1878年发表。Leadbeater & Besant还进一步观察了各种化学物质的详细原子结构，发现了同位素的存在并观察到了几个当时未发现的元素。那时候，卢瑟福还没有建立原子的近代模型，同位素的概念更是很久以后的事情。就是到了今天，现代物理学不论是标准模型还是超弦模型都没有超出这个模型。现在药物的氘代是一个热门领域，Leadbeater & Besant在1895年就观察到了氘代以及其生理活性影响。据说，爱因斯坦很喜欢读Leadbeater & Besant的老师HP Blavatsky的著作，不知道别的物理学家是否也会从中找到灵感。
所有的存在都具有物质，能量和意识这三个属性。高位面的存在以能量为主导，低位面的存在以物质为主导。以相关的意识属性来划分，物质又可划分为四种或者四个进化阶段，每个阶段持续很多亿年。
在鸿蒙海中诞生于第49位面的物质为第一级物质，它是最基本和未进化的。每一个原子在诞生于鸿蒙海的空泡时，产生了旋转运动。第一级物质可以聚集成更大更致密的原子和分子。它的主要功用是构成第49位面的本底。它的意识属性很低，无法构建复杂的物质形相，比如思想形相和生命形相。当它充满第49位面后，就逐渐向更低的位面降落，经过数万亿年，降至第1位面后再缓慢分解回升到49位面。在这个过程中，它不断释放所携带的零点能，它是宇宙的能量源泉。
当第一级物质经过足够回合的聚集和分解后，它被太一注入新的意识能量，从一个7-原子开始成为第二级物质。第二级物质具有被动的意识属性，但它缺乏愿力，所以无法根据自己的意愿行动。但是它可以对外在影响做出反应，能用来构造临时的形相，比如思想形相。当这些形相所携带的能量耗尽时，它们将分解。第二级物质只有被动的意识，它的进化依赖于更高等的生命对它的利用。第二级物质的历程是从第7基本位面到第1基本位面不断的坠落。意志力低下的人会发现很难抵抗由第二级物质构成的欲望和情感，这来源于第二级物质的被动堕落属性。
当第二级物质坠落到第一位面时，它积累到了主动表达意识的阶段，它成为第三级物质开始向第7位面上升。第三级物质的发展仍然依赖于更高等的生命。不同于第二级物质构成临时的形相，第三级物质构成高等生命的永久性身体，比如魂魄/查克拉/经络。第三级物质可以通过学习来履行自动的任务。人类的身体全部由第三级物质构成，它们的微弱意识使细胞和器官能协同工作来实现基本的功能。第三级物质可以存储记忆。器官移植的病人有时会具有原器官主人的记忆和行为，就是来源于第三级物质的意识。
当第三级物质上升到第7位面成为一个第7原子，它的一个第49原子被太一注入愿力，这个49-原子成为第四级物质，它就是人的元神/自性。
这个过程道家描述为：“太一生水,水反辅太一,是以成天. 天反辅太一,是以成地. 天地复相辅也, 是以成神明”. 水: 第一级物质, 天: 第二级物质, 地: 第三级物质, 神: 第四级物质.
