林彪事件中一个比较大的谜团，是“周恩来在林彪机毁人亡后痛哭”。有关“周恩来在林彪机毁人亡后痛哭”的记述，一般认为是出自纪登奎的回忆。纪的有关回忆是：
“当时最紧张的情形刚刚过去，大家都松了一口气。中央政治局成员还留在人大会堂集体办公。一天，当时协助抓国务院业务组工作的先念和我有事需要向总理汇报，见总理独自一人坐在他临时的办公室里发呆，一副心事重重的样子。我们两人不知道他究竟为什么事情闷闷下乐，便进去好言劝慰。开始时，总理只是听着，一言下发。后来当听我说到‘林彪已经自我爆炸了，现在应该高兴才是，今后可以好好抓一下国家的经济建设了’这样一席话时，显然是触动了他的心事，总理先是默默地流泪，后来渐渐哭出声来，接着又号啕大哭起来，其间曾几度哽咽失声。我们两人见总理哭得这么伤心，一时下知说什么好，就站在一边陪着。最后，总理慢慢平静下来，半天才吐出一句话来：‘你们不明白，事情不那么简单，还没有完……’，下面就什么也不肯再说了。”
纪登奎叙述的这段话，看不出哪里有造假的痕迹，而且当时纪应该没有任何动机去编造这些内容。特别是文中提到了有李先念在场，似乎更增加了这段内容的真实程度。
