一，用非法手段监视党和国家领导人，这条罪与令计划是挂上钩的，马建是听命于令计划，因此令计划出事就必然要牵涉到马建。
二，泄露国家情报罪名。周永康在位期间多次会见国外的情报机关头目，周与这些情报机关头目的会面全部是由马建一手安排。马建是负责海外情报系统的负责人，他安排他的对手与中共的安全部门总负责人周永康见面，这是他工作份内的事情，似乎没有可以指责的地方。问题是海外情报机关负责人急于要与周见面，马建在会见的时间，会见时的内容等方面，马建与海外情报机关有某种交易，这是马建犯忌的地方。
三，收受巨额贿赂，马建通过政泉公司的郭文贵认识了方正证券CEO李友，并接受了2.5亿元的巨额贿赂，交易过程是在郭文贵的盘古大观楼内进行，马建的妹妹亲自去该处提走现金。马建还接受了郭文贵提供的盘古大观2套房子，价值数千万。
四，洗钱，马建利用国安部的优势，在海外建立了庞大的洗钱管道，他使用的方法基本上是打一批和保一批，听话的就留下，不听话的就收拾。这些洗钱管道分布在欧洲北美和亚洲数个国家，马建利用这些管道洗白的资金，收买一些海外的线人和华人侨团领袖为其情报工作服务。甚至一些蛇头也利用马建这个管道洗钱和转移资金。掌控整个洗钱管道的国安部两位高官最近落马，这个管道中有大量的洗钱资金被马建及其同伙占有。
五，滥用职权。马建多次指使国安部门的下属，以国家安全利益为名干涉一些普通的民事案件，马建在北京，天津，河南，河北等地多次为商人郭文贵处理法律纠纷。2013年12月19日郭文贵被中纪委约谈，主要涉及到民族证券收购中的违规操作事情。马建获悉后利用其干姐马馼在中纪委的铁关系，将郭文贵释放。 2013年12月22日郭文贵获释回到寓所，第二天下午郭文贵从北京首都机场乘飞机飞往香港，郭文贵使用的是香港单程证件和港澳通行证,郭文贵在这些证件上使用的是化名郭浩云(出生日期：1968年5月10日)，而出境的照片中显示的是郭文贵本人。当时郭文贵是被列入了边控，无法出境。马建则利用其权利，强行解开郭文贵的边控设置，使得郭文贵能顺利出逃。
六，散布虚假消息，构陷党和国家领导人。马建利用其安全部门的情报优势，向海外媒体故意泄露党和国家领导人的虚假信息。
七，与多名女性通奸等。马建的情人队伍可以列出一打，中央电视台和军队的文工团中不乏他的情人。令计划之子令谷车祸当晚，马建也是在郭文贵的盘古大观楼内等待令谷送来藏族美女“尝鲜”。
消息人士透露，中共高层2015年反腐有两个重点，一个是情治部门，一个是金融系统。马建落马是在国安部门中反腐开了个头，整肃还远远没有结束。而金融部门依然是死水一潭，有人还在那里捂盖子
