李斯师从的荀况，本是出身儒家、兼通法家、名家各派的通人，李斯对于儒术自然不是外行。不过，李斯并不曾参予礼乐、服饰的制定与封禅勒石的歌功颂德。这些事儿，在李斯看来，纯属可有可无的把戏，他宁可躲一边，让博士这类他心目中的腐儒去主持。可一旦听到博士们非议郡县制这一由他设计的施政制度，李斯就沉不住气了。
“淳于越自以为得孔子真传，其实是个十足的腐儒。孔子是什么人物？孟子称之为‘圣之时者也’。如何方能为‘圣之时者也’？生今之世、仿古之道，如何能？审时度势，与世推移才能嘛！陛下废封建、立郡县，实乃万世不朽之伟业。非腐儒所知，万不可中道而止！”
“丞相所言甚是。无奈黔首无知，迂腐者众。为之奈何？”赵正问。
李斯道：“黔首之所以敢于抨击朝政，无非引经据典。陛下不妨下令：非秦国之史记，一律销毁。诗书、百家之言，仅得存朝廷，由博士负责讲解。民间所藏，限三十日送郡县烧毁。违者，发配边疆为戍城之卒。有敢私自探讨诗书百家之言者，弃市。以古非今者，族。吏知情不举，同罪。”
所谓弃市，就是处以死刑。古时执行死刑，于闹市斩首，弃尸示众，所以得弃市之名。所谓族，就是处死父、母、妻三族亲属。李斯这一招，够狠。正合狠人赵正心意，始皇帝于是下诏，著为法令。史称“焚书”。
早在一统天下之始，始皇帝就开始寻求长生不老之术。既经焚书而一统舆论，始皇帝对长生不老的追求更加执着。这类事情，李斯也从不插手，同样留给他心目中的腐儒。钻营这机会的腐儒不乏其人，先有徐市、韩终，后有卢生、侯生等等。秦时，“市”、“芾”同写作“市”。徐市的“市”读若“芾”。也有写作“福”的，恐是后人在“市”旁用“福”字注音，又被更后的人误会为正文，取代了原文的“市”字。徐市哄骗赵正：求长生不老之术，得问神仙。神仙何在？东海之中有瀛洲、方丈、蓬莱三岛，虚无缥缈，那就是神仙居停之所。赵正吩咐使者去山东半岛一打听，还真有人时不时瞥见海中仙境，从而信以为真。仙境怎么去？徐市自告奋勇，率数千童男童女乘大船出海而东去。一去却渺如黄鹤，再不见其踪影。葬身大海？还是去了东瀛？无从考核。
韩终与徐市一样，得了大笔赏赐之后，往而不返，莫之所终。卢生与侯生大捞一把之后，也如徐、韩一样逃之夭夭。不过，这两人不像徐、韩那么厚道，临溜之前对自己作了一番漂白，对赵正则作了一番抹黑。
“始皇帝为人，天性刚戾自用，以刑杀为威，图利贪权。这种人怎能与长生不老之药有缘？”
这话传到赵正耳中，自然令赵正气冲牛斗。有善于溜须拍马又嫉妒儒生受宠的，乘机进谗，说什么咸阳城里的儒生没几个好东西，大都像卢生、侯生一样，整日以诽谤朝廷与皇帝为务。当时云集咸阳混饭吃的儒生究竟有多少？确切数字无从考核。据史册记载，仅仅在观象台替始皇帝望气的就有三百之多。由此估计，少说也得有个三、五千。
人在气头容易听信谗言，赵正也不能例外，立即令御史对儒生的言论进行彻底调查。御史把众儒生换来，搞个背靠背式的人人过关。这帮儒生还真没种，经不住御史的恐吓，忙不迭相互检举揭发，最终捅出犯禁令者四百六十人。赵扶苏听到消息，心生恻隐，上书始皇帝，称“诸生皆诵法孔子”，望始皇帝看在孔子的面子上从宽发落，减死一等。赵正得书，掷之于地，道：“孔子曰：‘朝闻道，夕死可矣。’这帮家伙贪生怕死，自相揭发，猪狗不如。哪是什么孔子之徒！”不允赵扶苏之请，全数坑于咸阳，以收杀鸡儆猴之效。史称“坑儒”。
“焚书”与“坑儒”两案，往往被后人征引为儒家在秦代挨整的铁证。其实，“焚书”与“坑儒”，恰好是秦代尊儒的铁证。不尊儒，把儒家经典烧掉不就成了么？为何还要藏之朝廷、设博士执掌之？可见焚书的目的，并不在禁儒，而在于垄断对儒家学说的讲解权。如此这般的目的又何在？唯一合理的解释，只能是尊奉儒家学说为秦代的官学。不尊儒，儒生何得聚之于秦都咸阳以千百计？赵扶苏又何能试图以“诸生皆诵法孔子”为说辞以解救儒生？据《史记》，秦始皇死后，陈胜起兵之时，秦二世还曾“召博士诸儒生”问计。参与这次会议的博士，有叔孙通其人，感觉局势不妙，与会之后弃官而逃，跟着他逃奔的儒生数以百计。可见在相互检举揭发出四百六十馀人被坑之后，依然有大把的博士、儒生在秦朝廷备顾问、当参谋、混饭吃。证明儒家之受尊崇，亦不曾因坑儒事件而终止。
坑儒事件虽与李斯无关，李斯还是打了个冷战：别搞不好哪天也叫主子给坑了！怎么防备？重施当年收买六国宠臣的故计，不惜重金买通了赵正身边的一位亲随。一日，赵正登望宫山望远，望见一队车骑从山下路过。旌旗招展、尘土飞扬、人马杂沓。
“很威风嘛！谁的车队？”赵正问左右。
有知道的回答道：“丞相斯。”
过不几日，赵正再登望宫山，又见李斯从山下过，却仅有寥寥三五随从。怪了！李斯怎么会突然精车简骑？难道是…..想到这里，赵正勃然大怒，吼一声：谁走漏了风声？
没人回答，没人敢回答。不回答就能躲得过么？当然不能。赵正吩咐廷尉：但凡那一日站在赵正身边、有可能听到他那句“很威风嘛”的，统统弃市。
听到这消息，李斯持着酒杯的右手不由得一抖，把半杯酒洒到席上。如果是一人在喝闷酒，洒了也就洒了，有什么相干？可偏偏是在大宴宾客的场合！有什么大事值得庆祝么？其实没有，不过是官居三川郡郡守的长子李由回咸阳省亲而已。自从精车减骑之后，李斯凡事格外谨小慎微。对于李由的归省，也极力低姿态处理，谁也没通知。无奈消息依然不胫而走，百官皆来道贺，门庭车马数以千计，府前府后、府左府右，数十来条街衢都为之水泄不通。既来之，李斯如何能不设宴款待，总不能叫客人吃闭门羹吧？
幸亏当时已经酒过三巡，有些客人已经醉了，无从注意到主人的失态。没醉的，误以为主人的失态不过因为主人醉了。谁没喝醉过？琐屑一桩，何足挂齿？等客人都走了，李斯退回书房，嘬下两口茗茶，发一声叹息：物禁大盛！他以为他懂荀子的这句教诲，所以每逢遇到这种时刻，就能回想起来。他真懂么？真懂的人，怎么会遇到这种时刻？即使遇到，充其量只会有一次，怎么会每逢遇到？
