海關檢查一般可分普通檢查 ﹐詳細檢查, 和違禁品檢查三種。
普通檢查(General Exam)是指一般的例行性文件審核﹐海關檢查員一般不會對貨物本身進行檢查。
詳細檢查 (Intensive Exam 通常叫Trade Exam) 是由海關檢查員在各保稅倉庫和檢查站里進行拆櫃開包檢查﹐主要是核對貨物和報單﹐檢查有無違反原產國標誌及其他標籤﹐專利及商標和版權等相關法規。
違禁品檢查(Contraband Enforcement Team Exam, 通常叫CET Exam)一般先對整個貨櫃進行X光透視檢查(Vacis Exam)。如海關認為有必要進一步檢查﹐海關會指示檢查站安排拖櫃﹐在拆好貨櫃後再進行檢查﹐主要是針對毒品和其它違禁物品。
另外農業部(USDA)的檢查部門現已跟海關合併﹐該部門負責所有動植物進口檢疫工作﹐他們的檢查通常稱為AQI (Agriculture Quarantine Inspection).
