新冠病毒来源的探索曙光初现

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就在阴谋论和实验室泄漏论还甚嚣尘上的时候,广东的一些科研人员宣布,他们找到了新冠病毒的潜在中间宿主-穿山甲,从其体内找到的一种贝塔冠状病毒与新冠病毒的相似度达到99%。尽管他们还没有发表详细的结果,但从网上的一些资料,可以看到有关研究的大致轮廓。

首先是广东动物保护和资源利用重点实验室的Ping Liu等人,于2019年10月在MDPI旗下的病毒学刊物Viruses上发表了一篇文章(1),披露了他们对一些被截获的走私马来穿山甲的病毒宏基因组学研究,其中包括了冠状病毒,并发布了宏基因组数据(2)。

2019年11月底到12月初,一种新的病毒肺炎在武汉暴发。早期患者多数与华南海鲜市场有关联。1月初确定这种肺炎是由一种新型的冠状病毒2019-nCoV引起。

1月20日武汉病毒研究所石正丽的团队发表文章,发现云南蝙蝠的一种冠状病毒RaTG13与新冠状病毒2019-nCoV的基因在总体上有96%相似,证明蝙蝠冠状病毒是新冠状病毒的源头。但是蝙蝠冠状病毒一般不能直接感染人,很可能还存在一种或几种中间宿主。

1月30日,有个叫Matthew Wong的人在网上发表了一个帖子(实际上像是文章雏形)(3),称其通过对上述宏基因组数据的分析,发现穿山甲冠状病毒的S1受体结合部分与新冠状病毒高度相似(97%),而这个部分恰恰是新冠状病毒2019-nCoV与蝙蝠冠状病毒RaTG13最不吻合的区域。因此推测是某种蝙蝠冠状病毒感染了穿山甲,与穿山甲本身的冠状病毒发生了基因重组。

2月7日华南农业大学举行新闻发布会,宣布发现穿山甲是新冠病毒潜在中间宿主(4)。从新闻看,穿山甲中β冠状病毒的阳性率为70%,因此可能并不局限于上述马来穿山甲。


(1)https://www.mdpi.com/1999-4915/11/11/979
(2)https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA573298/
(3)http://virological.org/t/ncov-2019-spike-protein-receptor-binding-domain-shares-high-amino-acid-identity-with-a-coronavirus-recovered-from-a-pangolin-viral-metagenomic-dataset/362
(4)https://news.sina.com.cn/c/2020-02-07/doc-iimxxste9557742.shtml

*the author of ref (3) is Matthew Wong in Joe Petrosino’s lab at Baylor College of Medicine, Houston, TX.

 

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